10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1730 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1730  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  403  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240767  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0766  hypothetical protein  42.03 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.987289  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4019  hypothetical protein  36.32 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393141  decreased coverage  0.000309132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3179  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  92  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000569666  hitchhiker  0.000000000536578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8963  hypothetical protein  37.33 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0084  hypothetical protein  34.82 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0045  hypothetical protein  30 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0121  hypothetical protein  27.54 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0298502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14460  hypothetical protein  31.16 
 
 		 226 aa  45.4  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1965  hypothetical protein  27.91 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>