19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2571 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2571  HAD family hydrolase  100 
 
 		 247 aa  494  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.126591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4369  HAD family hydrolase  58.13 
 
 		 258 aa  310  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7699  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  47.06 
 
 		 253 aa  219  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2182  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  46.47 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.985055  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1662  hypothetical protein  43.03 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.247981 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0757  putative HAD superfamily hydrolase  41.74 
 
 		 268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3499  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  43.35 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.418198 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0593  eukaryotic phosphomannomutase  39.2 
 
 		 273 aa  192  4e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0589  HAD superfamily hydrolase  36.22 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000154059  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10710  phosphomannomutase (Sec53), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06580)  25.7 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39943  predicted protein  25.56 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.454292  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00170  phosphomannomutase, putative  26.01 
 
 		 271 aa  65.1  0.0000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77262  phosphomannomutase  24.5 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.181406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_28882  phosphomannose mutase  24.32 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00141159  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3241  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  23.63 
 
 		 274 aa  48.9  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0175  HAD family hydrolase  23.56 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1138  Cof protein  35.71 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0691805  normal  0.0113542 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0732  Cof-like hydrolase  22.22 
 
 		 287 aa  45.8  0.0006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.11 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.454773 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>