50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0412 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0412  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  371  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.763317  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4470  ETC complex I subunit region  44 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0372343  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1447  ETC complex I subunit region  39.73 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0078155  hitchhiker  0.000306871 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0548  ETC complex I subunit conserved region  40.28 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0438  ETC complex I subunit region  34.67 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594155 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2288  hypothetical protein  32.61 
 
 		 101 aa  53.9  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0685937  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1606  ETC complex I subunit region  32.1 
 
 		 115 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0537004  normal  0.0967266 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1099  ETC complex I subunit region  37.5 
 
 		 101 aa  53.9  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3141  ETC complex I subunit conserved region  35.71 
 
 		 101 aa  53.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352497  normal  0.0812065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1655  ETC complex I subunit conserved region  36.11 
 
 		 102 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1550  ETC complex I subunit region  34.72 
 
 		 101 aa  52.4  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.905582 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0517  ETC complex I subunit region  38.16 
 
 		 92 aa  52.8  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.255625 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3134  ETC complex I subunit region  34.67 
 
 		 103 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.281367  normal  0.0424451 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1496  ETC complex I subunit region  32.53 
 
 		 101 aa  51.6  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.820172 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3455  ETC complex I subunit conserved region  34.67 
 
 		 103 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3450  ETC complex I subunit region  36.25 
 
 		 112 aa  51.2  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0744456 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2807  ETC complex I subunit conserved region  30.77 
 
 		 101 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5438  ETC complex I subunit region  33.33 
 
 		 103 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.152182  normal  0.495614 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3331  ETC complex I subunit conserved region  33.33 
 
 		 103 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1552  ETC complex I subunit conserved region  34.25 
 
 		 101 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.450591 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2976  ETC complex I subunit region  26.32 
 
 		 218 aa  48.9  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194538 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1356  ETC complex I subunit region  39.47 
 
 		 92 aa  48.5  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.258248  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4044  putative ETC complex I subunit region protein  28.57 
 
 		 101 aa  48.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2935  ETC complex I subunit region  29.87 
 
 		 101 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.31253  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4634  ETC complex I subunit region  32.95 
 
 		 250 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2533  ETC complex I subunit region  28.38 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3683  ETC complex I subunit conserved region  41.67 
 
 		 250 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.899268 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0383  putative oxidoreductase  25.88 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0106  hypothetical protein  35.11 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172416 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2783  ETC complex I subunit region  30.14 
 
 		 125 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.227805 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1587  ETC complex I subunit region  32.88 
 
 		 103 aa  46.2  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0370097 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1309  ETC complex I subunit region  32.88 
 
 		 103 aa  46.2  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0213  putative oxidoreductase  30.26 
 
 		 104 aa  45.4  0.0004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1747  ETC complex I subunit conserved region  31.51 
 
 		 101 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.005711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0769  putative NADH dehydrogenase (quinone) subunit  29.41 
 
 		 101 aa  45.1  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.533148  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3008  ETC complex I subunit region  26.8 
 
 		 101 aa  44.7  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2569  ETC complex I subunit region  28.21 
 
 		 101 aa  43.9  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352299  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0695  ETC complex I subunit region  36.76 
 
 		 103 aa  43.9  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.158575  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0757  ETC complex I subunit region  31.94 
 
 		 103 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133354  normal  0.858187 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2082  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase-related protein  31.94 
 
 		 103 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.497528  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2191  putative ETC complex I subunit conserved region  27.78 
 
 		 103 aa  43.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0712  putative oxidoreductase  28.24 
 
 		 101 aa  43.5  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2126  ETC complex I subunit region  29.73 
 
 		 102 aa  43.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0303988  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01810  conserved hypothetical protein  28.38 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.2003  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0721  oxidoreductase, putative  28.24 
 
 		 101 aa  43.5  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23368  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4115  ETC complex I subunit region  38.33 
 
 		 225 aa  42.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.867373  normal  0.520861 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2880  ETC complex I subunit region  29.11 
 
 		 103 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1646  ETC complex I subunit region  30 
 
 		 99 aa  42  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.308114  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4182  ETC complex I subunit region  26.58 
 
 		 101 aa  41.2  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2210  ETC complex I subunit conserved region  34.92 
 
 		 248 aa  40.8  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>