56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2126 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2126  ETC complex I subunit region  100 
 
 		 102 aa  214  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0303988  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1606  ETC complex I subunit region  86.27 
 
 		 115 aa  183  7e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0537004  normal  0.0967266 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2533  ETC complex I subunit region  81.37 
 
 		 101 aa  179  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2935  ETC complex I subunit region  80.39 
 
 		 101 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.31253  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2807  ETC complex I subunit conserved region  77.45 
 
 		 101 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2783  ETC complex I subunit region  79.41 
 
 		 125 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.227805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4044  putative ETC complex I subunit region protein  77.45 
 
 		 101 aa  171  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4182  ETC complex I subunit region  58.82 
 
 		 101 aa  135  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0721  oxidoreductase, putative  58.82 
 
 		 101 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23368  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0712  putative oxidoreductase  58.82 
 
 		 101 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2569  ETC complex I subunit region  57.84 
 
 		 101 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352299  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2976  ETC complex I subunit region  58 
 
 		 218 aa  123  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194538 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1447  ETC complex I subunit region  53.92 
 
 		 101 aa  120  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0078155  hitchhiker  0.000306871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3008  ETC complex I subunit region  56.86 
 
 		 101 aa  119  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1587  ETC complex I subunit region  55.34 
 
 		 103 aa  118  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0370097 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1309  ETC complex I subunit region  55.34 
 
 		 103 aa  118  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0143  ETC complex I subunit region  53.4 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00000705205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1747  ETC complex I subunit conserved region  54.9 
 
 		 101 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.005711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1655  ETC complex I subunit conserved region  56.86 
 
 		 102 aa  117  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1496  ETC complex I subunit region  50 
 
 		 101 aa  117  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.820172 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1550  ETC complex I subunit region  51.96 
 
 		 101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.905582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0438  ETC complex I subunit region  54.9 
 
 		 102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594155 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5438  ETC complex I subunit region  49.5 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.152182  normal  0.495614 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2288  hypothetical protein  51.96 
 
 		 101 aa  114  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0685937  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1099  ETC complex I subunit region  50.98 
 
 		 101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3600  ETC complex I subunit protein  52.43 
 
 		 103 aa  110  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.538422  normal  0.995784 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1552  ETC complex I subunit conserved region  50.98 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.450591 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3331  ETC complex I subunit conserved region  48.51 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0548  ETC complex I subunit conserved region  52.94 
 
 		 101 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3134  ETC complex I subunit region  47.52 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.281367  normal  0.0424451 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2191  putative ETC complex I subunit conserved region  50.49 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3455  ETC complex I subunit conserved region  47.52 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0695  ETC complex I subunit region  54.46 
 
 		 103 aa  103  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.158575  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0769  putative NADH dehydrogenase (quinone) subunit  49.02 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.533148  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2082  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase-related protein  49.51 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.497528  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0757  ETC complex I subunit region  49.51 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133354  normal  0.858187 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3141  ETC complex I subunit conserved region  49.02 
 
 		 101 aa  99  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352497  normal  0.0812065 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2880  ETC complex I subunit region  47.57 
 
 		 103 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1356  ETC complex I subunit region  50 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.258248  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1646  ETC complex I subunit region  46 
 
 		 99 aa  90.9  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.308114  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0517  ETC complex I subunit region  50 
 
 		 92 aa  90.5  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.255625 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0213  putative oxidoreductase  48.35 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0791  ETC complex I subunit region  46.24 
 
 		 97 aa  84.3  5e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.85667  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3450  ETC complex I subunit region  46.67 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0744456 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0383  putative oxidoreductase  43.33 
 
 		 96 aa  77  0.00000000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01810  conserved hypothetical protein  45.05 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.2003  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0173  oxidoreductase, putative  41.94 
 
 		 99 aa  73.2  0.000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.042718  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07497  NADH-ubiquinone oxidoreductase 18 kDa subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05500)  44.09 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4634  ETC complex I subunit region  45.12 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2210  ETC complex I subunit conserved region  45.83 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62206  NADH-ubiquinone oxidoreductase 21 kDa subunit, mitochondrial precursor (Complex I-21KD) (CI-21KD)  36.89 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.246084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4470  ETC complex I subunit region  44 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0372343  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2075  hypothetical protein  34.78 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.430921  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4115  ETC complex I subunit region  43.75 
 
 		 225 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.867373  normal  0.520861 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3683  ETC complex I subunit conserved region  37.7 
 
 		 250 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.899268 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0412  hypothetical protein  29.73 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.763317  normal  0.777331 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>