62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2210 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2210  ETC complex I subunit conserved region  100 
 
 		 248 aa  498  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3683  ETC complex I subunit conserved region  46.52 
 
 		 250 aa  169  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.899268 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4115  ETC complex I subunit region  50.46 
 
 		 225 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.867373  normal  0.520861 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4634  ETC complex I subunit region  40.2 
 
 		 250 aa  116  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5438  ETC complex I subunit region  47.44 
 
 		 103 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.152182  normal  0.495614 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0695  ETC complex I subunit region  46.05 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.158575  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0438  ETC complex I subunit region  41.05 
 
 		 102 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594155 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1099  ETC complex I subunit region  47.95 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2976  ETC complex I subunit region  50 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194538 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1550  ETC complex I subunit region  45.95 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.905582 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0548  ETC complex I subunit conserved region  43.84 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1655  ETC complex I subunit conserved region  38.95 
 
 		 102 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3331  ETC complex I subunit conserved region  43.75 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2807  ETC complex I subunit conserved region  47.22 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3134  ETC complex I subunit region  42.5 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.281367  normal  0.0424451 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3455  ETC complex I subunit conserved region  42.5 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1606  ETC complex I subunit region  47.22 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0537004  normal  0.0967266 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1747  ETC complex I subunit conserved region  36.17 
 
 		 101 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.005711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1552  ETC complex I subunit conserved region  37.23 
 
 		 101 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.450591 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1496  ETC complex I subunit region  43.06 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.820172 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4044  putative ETC complex I subunit region protein  40.51 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2126  ETC complex I subunit region  45.83 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0303988  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3141  ETC complex I subunit conserved region  44.05 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352497  normal  0.0812065 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2533  ETC complex I subunit region  39.77 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2935  ETC complex I subunit region  39.77 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.31253  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2569  ETC complex I subunit region  40.28 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352299  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3008  ETC complex I subunit region  41.03 
 
 		 101 aa  62  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0712  putative oxidoreductase  43.06 
 
 		 101 aa  61.6  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0721  oxidoreductase, putative  43.06 
 
 		 101 aa  61.6  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23368  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1447  ETC complex I subunit region  40.43 
 
 		 101 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0078155  hitchhiker  0.000306871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2783  ETC complex I subunit region  44.44 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.227805 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0517  ETC complex I subunit region  45.71 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.255625 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1587  ETC complex I subunit region  45.95 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0370097 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1309  ETC complex I subunit region  45.95 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0143  ETC complex I subunit region  42.86 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00000705205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2191  putative ETC complex I subunit conserved region  45.71 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0383  putative oxidoreductase  46.38 
 
 		 96 aa  57.8  0.0000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1646  ETC complex I subunit region  41.1 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.308114  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1356  ETC complex I subunit region  44.12 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.258248  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4182  ETC complex I subunit region  37.5 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2288  hypothetical protein  34.78 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0685937  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3450  ETC complex I subunit region  45.07 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0744456 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0769  putative NADH dehydrogenase (quinone) subunit  35.94 
 
 		 101 aa  54.7  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.533148  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1150a  hypothetical cytosolic protein  40.28 
 
 		 104 aa  54.3  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.759317  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3600  ETC complex I subunit protein  41.18 
 
 		 103 aa  53.1  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.538422  normal  0.995784 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0757  ETC complex I subunit region  45.45 
 
 		 103 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133354  normal  0.858187 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2082  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase-related protein  45.45 
 
 		 103 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.497528  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2880  ETC complex I subunit region  45.45 
 
 		 103 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0432  hypothetical protein  46.15 
 
 		 164 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2115  hypothetical protein  41.03 
 
 		 114 aa  49.7  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4470  ETC complex I subunit region  42.03 
 
 		 170 aa  49.3  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0372343  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0213  putative oxidoreductase  36.49 
 
 		 104 aa  48.1  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4264  hypothetical protein  47.22 
 
 		 162 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.134049 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4631  hypothetical protein  47.22 
 
 		 165 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0537767  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0173  oxidoreductase, putative  36.99 
 
 		 99 aa  47.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.042718  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2211  hypothetical protein  39.73 
 
 		 126 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.794327  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0791  ETC complex I subunit region  35.71 
 
 		 97 aa  45.4  0.0008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.85667  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2075  hypothetical protein  46.88 
 
 		 162 aa  44.3  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.430921  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4549  hypothetical protein  36.62 
 
 		 126 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07497  NADH-ubiquinone oxidoreductase 18 kDa subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05500)  32.88 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4309  hypothetical protein  35.21 
 
 		 126 aa  42.4  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01810  conserved hypothetical protein  34.21 
 
 		 179 aa  42  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.2003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>