55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1747 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1747  ETC complex I subunit conserved region  100 
 
 
101 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.005711  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1552  ETC complex I subunit conserved region  96.04 
 
 
101 aa  204  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.450591 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2288  hypothetical protein  82.18 
 
 
101 aa  178  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0685937  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1447  ETC complex I subunit region  80.2 
 
 
101 aa  173  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0078155  hitchhiker  0.000306871 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2569  ETC complex I subunit region  63.37 
 
 
101 aa  141  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352299  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0721  oxidoreductase, putative  62.38 
 
 
101 aa  138  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23368  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0712  putative oxidoreductase  62.38 
 
 
101 aa  138  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2533  ETC complex I subunit region  59.41 
 
 
101 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1099  ETC complex I subunit region  63.73 
 
 
101 aa  130  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4044  putative ETC complex I subunit region protein  56.44 
 
 
101 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3008  ETC complex I subunit region  61.39 
 
 
101 aa  128  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526556  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1550  ETC complex I subunit region  55.45 
 
 
101 aa  126  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.905582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1655  ETC complex I subunit conserved region  58 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4182  ETC complex I subunit region  55.45 
 
 
101 aa  124  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0438  ETC complex I subunit region  58 
 
 
102 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594155 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2807  ETC complex I subunit conserved region  56.44 
 
 
101 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2935  ETC complex I subunit region  55.45 
 
 
101 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.31253  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0548  ETC complex I subunit conserved region  56.44 
 
 
101 aa  121  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1496  ETC complex I subunit region  54.46 
 
 
101 aa  121  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.820172 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2783  ETC complex I subunit region  56.44 
 
 
125 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.227805 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5438  ETC complex I subunit region  53.47 
 
 
103 aa  119  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.152182  normal  0.495614 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1606  ETC complex I subunit region  54.46 
 
 
115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0537004  normal  0.0967266 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2976  ETC complex I subunit region  53.54 
 
 
218 aa  115  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.194538 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3331  ETC complex I subunit conserved region  55.45 
 
 
103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3134  ETC complex I subunit region  54.46 
 
 
103 aa  115  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.281367  normal  0.0424451 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3455  ETC complex I subunit conserved region  54.46 
 
 
103 aa  115  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3600  ETC complex I subunit protein  55.34 
 
 
103 aa  110  9e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.538422  normal  0.995784 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2126  ETC complex I subunit region  53.92 
 
 
102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0303988  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0769  putative NADH dehydrogenase (quinone) subunit  48.51 
 
 
101 aa  107  7.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.533148  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3141  ETC complex I subunit conserved region  52.48 
 
 
101 aa  106  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352497  normal  0.0812065 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0143  ETC complex I subunit region  51.46 
 
 
103 aa  103  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00000705205  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0695  ETC complex I subunit region  52 
 
 
103 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.158575  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2191  putative ETC complex I subunit conserved region  50.49 
 
 
103 aa  101  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1309  ETC complex I subunit region  46.6 
 
 
103 aa  99  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1587  ETC complex I subunit region  46.6 
 
 
103 aa  99  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0370097 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1356  ETC complex I subunit region  53.76 
 
 
92 aa  94.7  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.258248  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3450  ETC complex I subunit region  47.19 
 
 
112 aa  89.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0744456 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2880  ETC complex I subunit region  44.66 
 
 
103 aa  87.8  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0517  ETC complex I subunit region  47.87 
 
 
92 aa  86.7  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.255625 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0757  ETC complex I subunit region  44.23 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133354  normal  0.858187 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2082  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase-related protein  44.23 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.497528  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1646  ETC complex I subunit region  45.36 
 
 
99 aa  83.6  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.308114  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0213  putative oxidoreductase  45.05 
 
 
104 aa  79  0.00000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0791  ETC complex I subunit region  41.76 
 
 
97 aa  77.8  0.00000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.85667  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0383  putative oxidoreductase  42.22 
 
 
96 aa  77.8  0.00000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07497  NADH-ubiquinone oxidoreductase 18 kDa subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05500)  40.43 
 
 
221 aa  67  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2210  ETC complex I subunit conserved region  36.17 
 
 
248 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4634  ETC complex I subunit region  41.56 
 
 
250 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0173  oxidoreductase, putative  36.36 
 
 
99 aa  63.9  0.0000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.042718  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01810  conserved hypothetical protein  38.96 
 
 
179 aa  59.7  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.2003  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4470  ETC complex I subunit region  39.73 
 
 
170 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0372343  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62206  NADH-ubiquinone oxidoreductase 21 kDa subunit, mitochondrial precursor (Complex I-21KD) (CI-21KD)  36 
 
 
118 aa  57.4  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.246084  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4115  ETC complex I subunit region  37.7 
 
 
225 aa  52  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.867373  normal  0.520861 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3683  ETC complex I subunit conserved region  36.51 
 
 
250 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.899268 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0412  hypothetical protein  31.51 
 
 
180 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.763317  normal  0.777331 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>