56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2288 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2288  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  213  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0685937  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1747  ETC complex I subunit conserved region  82.18 
 
 		 101 aa  178  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.005711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1552  ETC complex I subunit conserved region  82.18 
 
 		 101 aa  178  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.450591 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1447  ETC complex I subunit region  77.23 
 
 		 101 aa  169  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0078155  hitchhiker  0.000306871 
 
 
-
 
NC_004310  BR0721  oxidoreductase, putative  64.36 
 
 		 101 aa  145  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23368  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0712  putative oxidoreductase  64.36 
 
 		 101 aa  145  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2569  ETC complex I subunit region  63.37 
 
 		 101 aa  144  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352299  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1550  ETC complex I subunit region  57.43 
 
 		 101 aa  130  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.905582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1655  ETC complex I subunit conserved region  60 
 
 		 102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5438  ETC complex I subunit region  57.43 
 
 		 103 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.152182  normal  0.495614 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2533  ETC complex I subunit region  57.43 
 
 		 101 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4044  putative ETC complex I subunit region protein  55.45 
 
 		 101 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1099  ETC complex I subunit region  61.39 
 
 		 101 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0438  ETC complex I subunit region  59 
 
 		 102 aa  127  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594155 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2807  ETC complex I subunit conserved region  56.44 
 
 		 101 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2935  ETC complex I subunit region  54.46 
 
 		 101 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.31253  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3008  ETC complex I subunit region  59.41 
 
 		 101 aa  124  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3331  ETC complex I subunit conserved region  59.41 
 
 		 103 aa  124  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0548  ETC complex I subunit conserved region  57.43 
 
 		 101 aa  123  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3455  ETC complex I subunit conserved region  58.42 
 
 		 103 aa  123  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3134  ETC complex I subunit region  58.42 
 
 		 103 aa  123  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.281367  normal  0.0424451 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1496  ETC complex I subunit region  55.45 
 
 		 101 aa  122  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.820172 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1606  ETC complex I subunit region  53.47 
 
 		 115 aa  121  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0537004  normal  0.0967266 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4182  ETC complex I subunit region  51.49 
 
 		 101 aa  120  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2783  ETC complex I subunit region  54.46 
 
 		 125 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.227805 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2976  ETC complex I subunit region  52.53 
 
 		 218 aa  114  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194538 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3600  ETC complex I subunit protein  55.34 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.538422  normal  0.995784 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0769  putative NADH dehydrogenase (quinone) subunit  48.51 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.533148  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1587  ETC complex I subunit region  49.51 
 
 		 103 aa  107  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0370097 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1309  ETC complex I subunit region  49.51 
 
 		 103 aa  107  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2126  ETC complex I subunit region  50.98 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0303988  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0695  ETC complex I subunit region  52 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.158575  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2191  putative ETC complex I subunit conserved region  49.51 
 
 		 103 aa  103  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3141  ETC complex I subunit conserved region  48.51 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352497  normal  0.0812065 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0143  ETC complex I subunit region  48.54 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00000705205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1356  ETC complex I subunit region  55.91 
 
 		 92 aa  97.8  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.258248  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0383  putative oxidoreductase  46.67 
 
 		 96 aa  92.8  2e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2880  ETC complex I subunit region  46.15 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2082  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase-related protein  45.19 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.497528  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0757  ETC complex I subunit region  45.19 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133354  normal  0.858187 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1646  ETC complex I subunit region  46 
 
 		 99 aa  90.5  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.308114  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0517  ETC complex I subunit region  47.31 
 
 		 92 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.255625 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0213  putative oxidoreductase  48.31 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3450  ETC complex I subunit region  43.82 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0744456 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0791  ETC complex I subunit region  46.15 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.85667  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07497  NADH-ubiquinone oxidoreductase 18 kDa subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05500)  36.96 
 
 		 221 aa  67.4  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4470  ETC complex I subunit region  43.84 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0372343  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0173  oxidoreductase, putative  36.36 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.042718  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01810  conserved hypothetical protein  36.67 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.2003  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62206  NADH-ubiquinone oxidoreductase 21 kDa subunit, mitochondrial precursor (Complex I-21KD) (CI-21KD)  36.17 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.246084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4634  ETC complex I subunit region  40.26 
 
 		 250 aa  63.5  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3683  ETC complex I subunit conserved region  42.25 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.899268 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4115  ETC complex I subunit region  37.5 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.867373  normal  0.520861 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2210  ETC complex I subunit conserved region  34.78 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0412  hypothetical protein  32.61 
 
 		 180 aa  53.9  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.763317  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2075  hypothetical protein  41.03 
 
 		 162 aa  40  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.430921  normal  0.305499 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>