38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2075 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2075  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  318  3e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.430921  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4634  ETC complex I subunit region  37.84 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2210  ETC complex I subunit conserved region  47.06 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2126  ETC complex I subunit region  34.78 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0303988  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1646  ETC complex I subunit region  33.33 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.308114  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1606  ETC complex I subunit region  33.33 
 
 		 115 aa  51.2  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0537004  normal  0.0967266 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3683  ETC complex I subunit conserved region  42.42 
 
 		 250 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.899268 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2533  ETC complex I subunit region  34.78 
 
 		 101 aa  50.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1496  ETC complex I subunit region  34.18 
 
 		 101 aa  50.4  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.820172 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2807  ETC complex I subunit conserved region  33.33 
 
 		 101 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4044  putative ETC complex I subunit region protein  31.88 
 
 		 101 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2935  ETC complex I subunit region  32.91 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.31253  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0695  ETC complex I subunit region  46.15 
 
 		 103 aa  48.5  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.158575  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2783  ETC complex I subunit region  32.05 
 
 		 125 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.227805 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1747  ETC complex I subunit conserved region  28.74 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.005711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0517  ETC complex I subunit region  38.89 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.255625 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0383  putative oxidoreductase  28.77 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2288  hypothetical protein  31.65 
 
 		 101 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0685937  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0548  ETC complex I subunit conserved region  26.32 
 
 		 101 aa  45.1  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1552  ETC complex I subunit conserved region  29.89 
 
 		 101 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.450591 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1309  ETC complex I subunit region  33.33 
 
 		 103 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1587  ETC complex I subunit region  33.33 
 
 		 103 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0370097 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2191  putative ETC complex I subunit conserved region  31.82 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0721  oxidoreductase, putative  29.11 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23368  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1655  ETC complex I subunit conserved region  32.35 
 
 		 102 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3455  ETC complex I subunit conserved region  30.67 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3600  ETC complex I subunit protein  30.3 
 
 		 103 aa  43.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.538422  normal  0.995784 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3331  ETC complex I subunit conserved region  30.67 
 
 		 103 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0438  ETC complex I subunit region  32.35 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3134  ETC complex I subunit region  30.67 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.281367  normal  0.0424451 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3450  ETC complex I subunit region  33.33 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0744456 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0712  putative oxidoreductase  29.11 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4115  ETC complex I subunit region  37.97 
 
 		 225 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.867373  normal  0.520861 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2976  ETC complex I subunit region  30.43 
 
 		 218 aa  42.4  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194538 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1356  ETC complex I subunit region  36.23 
 
 		 92 aa  42.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.258248  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2569  ETC complex I subunit region  26.58 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352299  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5438  ETC complex I subunit region  46.15 
 
 		 103 aa  41.6  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.152182  normal  0.495614 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3141  ETC complex I subunit conserved region  33.33 
 
 		 101 aa  40.8  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352497  normal  0.0812065 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>