12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1031 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1031  TOPRIM domain protein  100 
 
 
114 aa  223  6e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1513  TOPRIM domain-containing protein  29.35 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.311069  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1520  TOPRIM domain-containing protein  29.35 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0337189  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1527  TOPRIM domain-containing protein  29.35 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  36.84 
 
 
539 aa  44.7  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1426  TOPRIM domain protein  28.57 
 
 
131 aa  44.3  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.737978  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  31.25 
 
 
595 aa  43.5  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  31.25 
 
 
595 aa  43.5  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1322  hypothetical protein  30.43 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  28.92 
 
 
593 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  33.78 
 
 
662 aa  41.2  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  34.67 
 
 
640 aa  40.8  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>