14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1527 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1513  TOPRIM domain-containing protein  100 
 
 
147 aa  290  6e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.311069  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1520  TOPRIM domain-containing protein  100 
 
 
147 aa  290  6e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0337189  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1527  TOPRIM domain-containing protein  100 
 
 
147 aa  290  6e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0484  hypothetical protein  39.2 
 
 
143 aa  102  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.76592 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1322  hypothetical protein  38.52 
 
 
158 aa  92  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1325  bifunctional RNAse/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  31.13 
 
 
360 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.264081  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0230  bifunctional RNAse/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  30.33 
 
 
360 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0659  bifunctional RNAse/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  25.83 
 
 
357 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0593  bifunctional RNAse/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  28.69 
 
 
360 aa  62  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.075481  normal  0.240855 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1426  TOPRIM domain protein  28.7 
 
 
131 aa  62.8  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.737978  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0661  hypothetical protein  29.25 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00355495  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1311  TOPRIM domain-containing protein  32.63 
 
 
124 aa  55.5  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000185507 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1031  TOPRIM domain protein  29.35 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23060  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  44.74 
 
 
334 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.1711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>