35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0631 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0631  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  325  1.0000000000000001e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1025  hypothetical protein  64.1 
 
 
157 aa  201  4e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.486494  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1168  hypothetical protein  42.68 
 
 
166 aa  134  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1451  hypothetical protein  42.58 
 
 
163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.218216  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1773  hypothetical protein  43.23 
 
 
179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00362767  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0230  hypothetical protein  40.91 
 
 
167 aa  130  5e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1001  hypothetical protein  41.03 
 
 
161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0156409  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2826  hypothetical protein  38.06 
 
 
167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25750  hypothetical protein  35.67 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0993  hypothetical protein  36.81 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3267  hypothetical protein  36.11 
 
 
163 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2474  hypothetical protein  36.11 
 
 
164 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1226  hypothetical protein  36.11 
 
 
164 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1951  hypothetical protein  36.11 
 
 
164 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3353  hypothetical protein  36.11 
 
 
164 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0417516  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2316  hypothetical protein  36.11 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.127724  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6210  hypothetical protein  34.18 
 
 
169 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411943  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5878  hypothetical protein  33.76 
 
 
169 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420141  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2357  hypothetical protein  35.42 
 
 
164 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2125  hypothetical protein  34.72 
 
 
164 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7034  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.814698 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1297  hypothetical protein  30.57 
 
 
208 aa  103  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.336493  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1900  hypothetical protein  33.76 
 
 
170 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.561652 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0379  hypothetical protein  33.99 
 
 
171 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129584  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3351  hypothetical protein  33.56 
 
 
165 aa  98.6  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.878366  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1488  hypothetical protein  28.66 
 
 
170 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0831619  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0044  hypothetical protein  35.53 
 
 
172 aa  96.3  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.893023 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1575  hypothetical protein  28.66 
 
 
170 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.622552  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0388  hypothetical protein  28.66 
 
 
170 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4387  hypothetical protein  34.19 
 
 
166 aa  94  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113252  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4519  hypothetical protein  34.19 
 
 
166 aa  94  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.541676  normal  0.505408 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1156  hypothetical protein  33.56 
 
 
167 aa  92  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5193  hypothetical protein  32.89 
 
 
167 aa  90.5  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0017  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  79  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000706359  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0024  hypothetical protein  31.71 
 
 
89 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.355297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>