35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3351 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3351  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  345  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.878366  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0379  hypothetical protein  61.31 
 
 		 171 aa  221  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129584  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0044  hypothetical protein  60.87 
 
 		 172 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.893023 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3267  hypothetical protein  54.43 
 
 		 163 aa  185  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0993  hypothetical protein  55.06 
 
 		 163 aa  186  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0017  hypothetical protein  41.76 
 
 		 172 aa  117  9e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000706359  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1025  hypothetical protein  37.41 
 
 		 157 aa  106  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.486494  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1451  hypothetical protein  30.3 
 
 		 163 aa  101  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.218216  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25750  hypothetical protein  37.93 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2826  hypothetical protein  35.56 
 
 		 167 aa  99.4  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1773  hypothetical protein  34.07 
 
 		 179 aa  99.4  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00362767  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0631  hypothetical protein  33.56 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1168  hypothetical protein  32.59 
 
 		 166 aa  97.1  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1900  hypothetical protein  32.89 
 
 		 170 aa  96.7  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.561652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1001  hypothetical protein  34.81 
 
 		 161 aa  95.1  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0156409  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0230  hypothetical protein  33.09 
 
 		 167 aa  86.7  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4519  hypothetical protein  33.57 
 
 		 166 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.541676  normal  0.505408 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4387  hypothetical protein  33.57 
 
 		 166 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7034  hypothetical protein  28.92 
 
 		 167 aa  84.7  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.814698 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5193  hypothetical protein  34.93 
 
 		 167 aa  84  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1156  hypothetical protein  33.57 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6210  hypothetical protein  32.86 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1297  hypothetical protein  30.53 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.336493  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1951  hypothetical protein  31.62 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1226  hypothetical protein  31.62 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2474  hypothetical protein  31.62 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3353  hypothetical protein  31.62 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0417516  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5878  hypothetical protein  31.43 
 
 		 169 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1488  hypothetical protein  30.53 
 
 		 170 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0831619  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1575  hypothetical protein  30.53 
 
 		 170 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.622552  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0388  hypothetical protein  30.53 
 
 		 170 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2125  hypothetical protein  30.88 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2316  hypothetical protein  31.62 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.127724  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2357  hypothetical protein  31.11 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0024  hypothetical protein  25.88 
 
 		 89 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.355297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>