34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_25750 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_25750  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  330  5e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1773  hypothetical protein  44.23 
 
 
179 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00362767  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1451  hypothetical protein  41.67 
 
 
163 aa  139  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.218216  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1001  hypothetical protein  43.59 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0156409  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0230  hypothetical protein  42.68 
 
 
167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1168  hypothetical protein  40.38 
 
 
166 aa  134  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2826  hypothetical protein  42.58 
 
 
167 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7034  hypothetical protein  44.59 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.814698 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1025  hypothetical protein  37.11 
 
 
157 aa  128  3e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.486494  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1900  hypothetical protein  40 
 
 
170 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.561652 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2474  hypothetical protein  38.31 
 
 
164 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1951  hypothetical protein  38.31 
 
 
164 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3353  hypothetical protein  38.31 
 
 
164 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0417516  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1226  hypothetical protein  38.31 
 
 
164 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2125  hypothetical protein  39.61 
 
 
164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2316  hypothetical protein  38.31 
 
 
164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.127724  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0631  hypothetical protein  35.67 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2357  hypothetical protein  37.66 
 
 
164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5878  hypothetical protein  40.13 
 
 
169 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420141  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6210  hypothetical protein  38.61 
 
 
169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411943  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4519  hypothetical protein  35.81 
 
 
166 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.541676  normal  0.505408 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4387  hypothetical protein  35.81 
 
 
166 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113252  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0993  hypothetical protein  36.11 
 
 
163 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3267  hypothetical protein  35.42 
 
 
163 aa  103  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3351  hypothetical protein  37.93 
 
 
165 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.878366  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1156  hypothetical protein  34.9 
 
 
167 aa  97.1  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5193  hypothetical protein  36.84 
 
 
167 aa  97.1  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1297  hypothetical protein  33.96 
 
 
208 aa  89  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.336493  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0044  hypothetical protein  32.89 
 
 
172 aa  88.2  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.893023 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0379  hypothetical protein  30.72 
 
 
171 aa  87.8  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129584  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0017  hypothetical protein  36.42 
 
 
172 aa  86.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000706359  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1488  hypothetical protein  32.7 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0831619  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1575  hypothetical protein  32.7 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.622552  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0388  hypothetical protein  32.7 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>