35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0993 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0993  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  337  4e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3267  hypothetical protein  97.55 
 
 		 163 aa  331  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0379  hypothetical protein  54.88 
 
 		 171 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129584  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3351  hypothetical protein  55.06 
 
 		 165 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.878366  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0044  hypothetical protein  52.05 
 
 		 172 aa  170  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.893023 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1451  hypothetical protein  38.89 
 
 		 163 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.218216  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0230  hypothetical protein  39.58 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1025  hypothetical protein  39.16 
 
 		 157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.486494  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1168  hypothetical protein  38.1 
 
 		 166 aa  114  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0017  hypothetical protein  40.85 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000706359  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0631  hypothetical protein  36.81 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1773  hypothetical protein  35.71 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00362767  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2826  hypothetical protein  36.81 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25750  hypothetical protein  36.11 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3353  hypothetical protein  36.36 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0417516  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1226  hypothetical protein  36.36 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1951  hypothetical protein  36.36 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2474  hypothetical protein  36.36 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2316  hypothetical protein  36.36 
 
 		 164 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.127724  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2357  hypothetical protein  36.36 
 
 		 164 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1001  hypothetical protein  36.99 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0156409  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2125  hypothetical protein  36.11 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1900  hypothetical protein  31.47 
 
 		 170 aa  91.7  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.561652 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7034  hypothetical protein  30.14 
 
 		 167 aa  87  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.814698 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4387  hypothetical protein  33.83 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4519  hypothetical protein  33.83 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.541676  normal  0.505408 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6210  hypothetical protein  31.47 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5193  hypothetical protein  30.23 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1156  hypothetical protein  31.01 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1488  hypothetical protein  28.15 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0831619  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1575  hypothetical protein  28.15 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.622552  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0388  hypothetical protein  28.15 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5878  hypothetical protein  29.37 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1297  hypothetical protein  26.67 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.336493  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0024  hypothetical protein  23.53 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.355297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>