34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4387 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4519  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  344  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.541676  normal  0.505408 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4387  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  344  3e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5193  hypothetical protein  61.45 
 
 		 167 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1156  hypothetical protein  61.45 
 
 		 167 aa  216  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1168  hypothetical protein  45.21 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1773  hypothetical protein  41.1 
 
 		 179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00362767  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1451  hypothetical protein  41.43 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.218216  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2826  hypothetical protein  43.59 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2357  hypothetical protein  40.49 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2125  hypothetical protein  42.31 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2316  hypothetical protein  42.31 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.127724  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1226  hypothetical protein  42.31 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3353  hypothetical protein  42.31 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0417516  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1951  hypothetical protein  42.31 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2474  hypothetical protein  42.31 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7034  hypothetical protein  35.54 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.814698 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1025  hypothetical protein  36.6 
 
 		 157 aa  114  7.999999999999999e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.486494  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1001  hypothetical protein  39.29 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0156409  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25750  hypothetical protein  35.81 
 
 		 159 aa  107  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0230  hypothetical protein  35.44 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1900  hypothetical protein  37.5 
 
 		 170 aa  104  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.561652 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6210  hypothetical protein  35.15 
 
 		 169 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5878  hypothetical protein  37.06 
 
 		 169 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0631  hypothetical protein  34.19 
 
 		 159 aa  94  8e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3351  hypothetical protein  33.57 
 
 		 165 aa  86.7  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.878366  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3267  hypothetical protein  34.59 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0379  hypothetical protein  32.85 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0993  hypothetical protein  33.83 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1297  hypothetical protein  30.71 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.336493  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0044  hypothetical protein  32.37 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.893023 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1488  hypothetical protein  27.86 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0831619  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1575  hypothetical protein  27.86 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.622552  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0388  hypothetical protein  27.86 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0017  hypothetical protein  27.14 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000706359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>