36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2826 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2826  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  343  6e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1773  hypothetical protein  55.56 
 
 
179 aa  184  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00362767  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1168  hypothetical protein  55.56 
 
 
166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1451  hypothetical protein  54.9 
 
 
163 aa  176  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.218216  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0230  hypothetical protein  46.06 
 
 
167 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2125  hypothetical protein  50 
 
 
164 aa  148  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2357  hypothetical protein  44.1 
 
 
164 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1025  hypothetical protein  43.14 
 
 
157 aa  144  6e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.486494  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1001  hypothetical protein  45.1 
 
 
161 aa  142  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0156409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1226  hypothetical protein  43.48 
 
 
164 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2474  hypothetical protein  43.48 
 
 
164 aa  140  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1951  hypothetical protein  43.48 
 
 
164 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3353  hypothetical protein  43.48 
 
 
164 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0417516  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2316  hypothetical protein  43.48 
 
 
164 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.127724  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25750  hypothetical protein  42.58 
 
 
159 aa  133  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5193  hypothetical protein  44.87 
 
 
167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1156  hypothetical protein  44.23 
 
 
167 aa  131  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1900  hypothetical protein  41.29 
 
 
170 aa  130  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.561652 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0631  hypothetical protein  38.06 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4387  hypothetical protein  43.59 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113252  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4519  hypothetical protein  43.59 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.541676  normal  0.505408 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5878  hypothetical protein  39.16 
 
 
169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420141  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7034  hypothetical protein  39.88 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.814698 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6210  hypothetical protein  41.83 
 
 
169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411943  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3267  hypothetical protein  37.5 
 
 
163 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1297  hypothetical protein  38.75 
 
 
208 aa  110  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.336493  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0993  hypothetical protein  36.81 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0017  hypothetical protein  40 
 
 
172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000706359  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1488  hypothetical protein  35.93 
 
 
170 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0831619  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1575  hypothetical protein  35.93 
 
 
170 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.622552  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0388  hypothetical protein  35.93 
 
 
170 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0044  hypothetical protein  37.65 
 
 
172 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.893023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3351  hypothetical protein  35.56 
 
 
165 aa  99.4  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.878366  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0379  hypothetical protein  31.54 
 
 
171 aa  96.3  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129584  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.71 
 
 
852 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.16452  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0024  hypothetical protein  32.94 
 
 
89 aa  44.7  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.355297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>