35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0708 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0708  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  716    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.251883  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1200  hypothetical protein  67.43 
 
 
345 aa  496  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1178  hypothetical protein  67.43 
 
 
345 aa  496  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.868968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3984  hypothetical protein  26.2 
 
 
344 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4052  hypothetical protein  26.2 
 
 
344 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.244783  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1864  SCP-like extracellular  27.55 
 
 
335 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3849  hypothetical protein  25.92 
 
 
344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3680  hypothetical protein  25.92 
 
 
344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3952  hypothetical protein  25.92 
 
 
344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4147  hypothetical protein  25.92 
 
 
344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4039  hypothetical protein  25.99 
 
 
344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.784658  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0992  SCP-like extracellular  25.17 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1200  hypothetical protein  25.99 
 
 
344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3697  hypothetical protein  25.15 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3764  SCP-like extracellular  24.42 
 
 
373 aa  112  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2640  hypothetical protein  24.07 
 
 
353 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0937186  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  27.87 
 
 
270 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  27.05 
 
 
275 aa  47  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  27.05 
 
 
275 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  27.05 
 
 
275 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  27.05 
 
 
275 aa  47  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  27.05 
 
 
275 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  27.05 
 
 
263 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  27.05 
 
 
275 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  27.05 
 
 
270 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0910  hypothetical protein  23.93 
 
 
184 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0940  hypothetical protein  23.93 
 
 
184 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  24.17 
 
 
347 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  26.23 
 
 
276 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  25.41 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  26.02 
 
 
280 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  25.44 
 
 
245 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  24.59 
 
 
203 aa  43.9  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  23.81 
 
 
205 aa  43.5  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.41 
 
 
322 aa  43.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>