28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0713 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2003  YibQ protein  98.11 
 
 		 477 aa  865    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0713  protein of unknown function DUF610, YibQ  100 
 
 		 477 aa  884    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.106897 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3100  protein of unknown function DUF610, YibQ  67.36 
 
 		 474 aa  501  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.482239 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1881  protein of unknown function DUF610, YibQ  46.09 
 
 		 575 aa  178  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.176772 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1142  hypothetical protein  41.82 
 
 		 519 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0823689 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1797  hypothetical protein  37.25 
 
 		 608 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.0000479521  normal  0.132264 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2408  protein of unknown function DUF610, YibQ  27.24 
 
 		 342 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000297515  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  29.61 
 
 		 2449 aa  58.5  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2286  protein of unknown function DUF610 YibQ  30.89 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665446  normal  0.0682308 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3159  protein of unknown function DUF610 YibQ  29.06 
 
 		 543 aa  57  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0142078 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2561  protein of unknown function DUF610 YibQ  30.5 
 
 		 401 aa  57  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0378408 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2243  protein of unknown function DUF610 YibQ  28.74 
 
 		 399 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.192281 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4734  protein of unknown function DUF610 YibQ  29.92 
 
 		 404 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00807968  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1438  hypothetical protein  27.83 
 
 		 488 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0614604  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0924  protein of unknown function DUF610, YibQ  30.54 
 
 		 461 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3062  protein of unknown function DUF610, YibQ  26.27 
 
 		 430 aa  50.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0491  protein of unknown function DUF610 YibQ  30.97 
 
 		 325 aa  48.9  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4726  protein of unknown function DUF610 YibQ  28.88 
 
 		 395 aa  47.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0150774 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1769  hypothetical protein  26.15 
 
 		 290 aa  47.4  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0298619  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2867  protein of unknown function DUF610 YibQ  25.73 
 
 		 433 aa  47  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00589273  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1471  protein of unknown function DUF610 YibQ  26.7 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4143  protein of unknown function DUF610 YibQ  25 
 
 		 336 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0073  divergent polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 336 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1850  protein of unknown function DUF610, YibQ  22.88 
 
 		 320 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000290484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1919  protein of unknown function DUF610 YibQ  23.11 
 
 		 334 aa  45.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000324213  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1253  protein of unknown function DUF610 YibQ  25.45 
 
 		 317 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2567  protein of unknown function DUF610, YibQ  25.57 
 
 		 264 aa  44.7  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245403  hitchhiker  0.00802538 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0491  hypothetical protein  24.87 
 
 		 382 aa  44.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>