More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2815 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2815  molybdopterin synthase subunit MoaE  100 
 
 
162 aa  325  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.818732  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1207  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  55.41 
 
 
173 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0824978  normal  0.0611166 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1268  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  55.13 
 
 
173 aa  168  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31619  normal  0.849988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13250  molybdopterin converting factor, large subunit  56.49 
 
 
150 aa  167  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.934669  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1192  molybdopterin converting factor large subunit  55.84 
 
 
150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.821537  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3143  molybdopterin biosynthesis MoaE  57.24 
 
 
155 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.756812  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1962  molybdopterin synthase subunit MoaE  54.66 
 
 
163 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000171752  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2729  molybdopterin synthase subunit MoaE  56.49 
 
 
150 aa  164  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0618886  normal  0.244943 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2523  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  58.62 
 
 
179 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1724  molybdopterin synthase subunit MoaE  57.52 
 
 
154 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.849895  normal  0.129542 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1036  molybdopterin synthase subunit MoaE  53.59 
 
 
150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.960287 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2523  molybdopterin biosynthesis MoaE  55.92 
 
 
155 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.271451 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1263  molybdopterin synthase subunit MoaE  52.94 
 
 
149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.228678 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1332  molybdopterin MPT converting factor subunit 2  56 
 
 
176 aa  161  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2273  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  54.3 
 
 
146 aa  160  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1027  molybdopterin synthase subunit MoaE  55.19 
 
 
151 aa  159  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.877253  decreased coverage  0.00128032 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1989  molybdopterin synthase subunit MoaE  56.21 
 
 
166 aa  157  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271107  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0442  molybdopterin biosynthesis protein MoaE  50.65 
 
 
154 aa  157  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2377  molybdopterin synthase subunit MoaE  52.5 
 
 
158 aa  157  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1870  molybdopterin converting factor, subunit 2  53.9 
 
 
162 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1380  molybdopterin converting factor, subunit 2  53.9 
 
 
162 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2392  molybdopterin converting factor, subunit 2  53.9 
 
 
162 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1142  molybdopterin converting factor, subunit 2  53.9 
 
 
162 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0512781  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0026  molybdopterin converting factor, subunit 2  53.9 
 
 
162 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.204651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2227  molybdopterin converting factor, subunit 2  53.25 
 
 
162 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.137574  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1547  molybdopterin synthase subunit MoaE  52.26 
 
 
165 aa  155  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2265  molybdopterin converting factor, subunit 2  53.25 
 
 
162 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0935  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  50 
 
 
158 aa  155  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.843261 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1249  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  52.63 
 
 
148 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2020  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  53.64 
 
 
159 aa  154  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5151  molybdopterin synthase subunit MoaE  54 
 
 
158 aa  152  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1788  molybdopterin biosynthesis MoaE  53.25 
 
 
158 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1760  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  51.57 
 
 
158 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.242707 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6229  molybdopterin biosynthesis MoaE  52.2 
 
 
158 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1850  molybdopterin biosynthesis MoaE  52.2 
 
 
158 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1874  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  52.6 
 
 
158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42646  hitchhiker  0.0000409453 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1174  molybdopterin biosynthesis MoaE  54.55 
 
 
155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398633  normal  0.371685 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1810  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  50 
 
 
158 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131712  normal  0.0769758 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1917  molybdopterin biosynthesis MoaE  49.68 
 
 
163 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.925858  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1837  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  51.33 
 
 
158 aa  151  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1359  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  53.9 
 
 
155 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1069  molybdopterin biosynthesis MoaE  51.63 
 
 
149 aa  150  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717042  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1423  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  53.33 
 
 
158 aa  150  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0306763  hitchhiker  0.00786823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3627  molybdopterin biosynthesis MoaE  49.06 
 
 
169 aa  149  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2077  molybdopterin synthase subunit MoaE  53.95 
 
 
152 aa  149  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000346647  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0104  molybdopterin biosynthesis MoaE  48.41 
 
 
156 aa  149  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00530793  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0160  molybdopterin biosynthesis MoaE  52.63 
 
 
155 aa  148  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000598821  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2226  molybdopterin biosynthesis MoaE  50 
 
 
157 aa  147  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209272 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0450  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  49.03 
 
 
175 aa  148  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000102312  normal  0.705903 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0966  molybdopterin biosynthesis MoaE  53.9 
 
 
150 aa  146  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1278  molybdopterin biosynthesis MoaE  53.57 
 
 
155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.271767 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4449  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  48.7 
 
 
155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5210  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  48.08 
 
 
153 aa  144  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.176681  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2551  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  47.13 
 
 
158 aa  144  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0276  molybdopterin synthase subunit MoaE  49.01 
 
 
155 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000334013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4555  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  50.65 
 
 
148 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3745  molybdopterin synthase subunit MoaE  49.33 
 
 
155 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0513249 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1248  molybdopterin synthase subunit MoaE  49.35 
 
 
172 aa  143  8.000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.736844  hitchhiker  0.00601757 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3199  molybdopterin synthase subunit MoaE  47.13 
 
 
158 aa  143  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4431  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  50.65 
 
 
148 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.722423 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0687  molybdopterin converting factor, subunit 2  46.15 
 
 
163 aa  142  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.962382  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3633  molybdopterin synthase subunit MoaE  52.94 
 
 
148 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.218035 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3103  molybdopterin-converting factor subunit 2  50.66 
 
 
147 aa  142  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.231664  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11280  Molybdopterin converting factor, large subunit  59.82 
 
 
148 aa  142  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481553  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3528  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  48.03 
 
 
152 aa  142  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1294  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  50 
 
 
148 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.526565  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0091  molybdopterin biosynthesis MoaE  50 
 
 
155 aa  140  8e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.313658  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0901  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  49.35 
 
 
148 aa  140  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246008  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0277  molybdopterin synthase subunit MoaE  48.34 
 
 
155 aa  140  8e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000211309 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1090  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  55.4 
 
 
164 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0976  molybdopterin converting factor, subunit 2  55.4 
 
 
164 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3916  molybdopterin synthase subunit MoaE  47.37 
 
 
147 aa  140  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0085  molybdopterin biosynthesis MoaE  48.05 
 
 
156 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0696  molybdopterin converting factor, subunit 2  45.51 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.289612  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2260  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  51.61 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.467293  normal  0.604415 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4116  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  46.71 
 
 
148 aa  138  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0904  molybdopterin biosynthesis MoaE  51.95 
 
 
152 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0392  molybdopterin biosynthesis MoaE  48.68 
 
 
153 aa  138  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4398  molybdopterin biosynthesis protein MoaE  48.03 
 
 
154 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0259139  hitchhiker  0.000211704 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0588  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  48.37 
 
 
163 aa  136  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.340802  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4789  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  47.71 
 
 
155 aa  136  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00106132  hitchhiker  0.000000156142 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0288  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  47.37 
 
 
155 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0287  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  47.37 
 
 
155 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0280  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  47.37 
 
 
155 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0284  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  47.37 
 
 
155 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1324  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  52.38 
 
 
156 aa  134  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.557298  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0548  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  48 
 
 
150 aa  134  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1437  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  49.03 
 
 
169 aa  134  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1507  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  54.81 
 
 
153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.343988  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0955  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  54.03 
 
 
150 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1786  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  54.07 
 
 
150 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.748073  normal  0.0454659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1507  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  54.07 
 
 
150 aa  133  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547533  normal  0.796007 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2857  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  54.03 
 
 
150 aa  133  9e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2858  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  54.03 
 
 
150 aa  133  9e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.629834  hitchhiker  0.00457417 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0900  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  54.03 
 
 
150 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2167  molybdopterin biosynthesis MoaE  43.42 
 
 
148 aa  133  9e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00752  molybdopterin synthase, large subunit  54.03 
 
 
150 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0932  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  54.03 
 
 
150 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1978  molybdopterin synthase subunit MoaE  46.75 
 
 
154 aa  132  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0848  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  54.03 
 
 
150 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.337133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>