More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1268 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1268  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  100 
 
 
173 aa  355  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31619  normal  0.849988 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1207  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  94.22 
 
 
173 aa  337  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0824978  normal  0.0611166 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1332  molybdopterin MPT converting factor subunit 2  88.24 
 
 
176 aa  286  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1989  molybdopterin synthase subunit MoaE  75.61 
 
 
166 aa  257  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271107  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1962  molybdopterin synthase subunit MoaE  74.84 
 
 
163 aa  244  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000171752  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2729  molybdopterin synthase subunit MoaE  74.32 
 
 
150 aa  230  6e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0618886  normal  0.244943 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2020  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  69.74 
 
 
159 aa  229  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2377  molybdopterin synthase subunit MoaE  67.53 
 
 
158 aa  229  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0935  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  66.45 
 
 
158 aa  229  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.843261 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1837  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  67.32 
 
 
158 aa  227  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1810  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  66.88 
 
 
158 aa  225  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131712  normal  0.0769758 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1423  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  67.1 
 
 
158 aa  225  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0306763  hitchhiker  0.00786823 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5151  molybdopterin synthase subunit MoaE  67.32 
 
 
158 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1874  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  66.01 
 
 
158 aa  223  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42646  hitchhiker  0.0000409453 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1917  molybdopterin biosynthesis MoaE  67.53 
 
 
163 aa  223  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.925858  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6229  molybdopterin biosynthesis MoaE  65.36 
 
 
158 aa  221  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1850  molybdopterin biosynthesis MoaE  65.36 
 
 
158 aa  221  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1760  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  64.71 
 
 
158 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.242707 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2227  molybdopterin converting factor, subunit 2  64.94 
 
 
162 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.137574  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1788  molybdopterin biosynthesis MoaE  64.71 
 
 
158 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2265  molybdopterin converting factor, subunit 2  64.94 
 
 
162 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1380  molybdopterin converting factor, subunit 2  64.29 
 
 
162 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2392  molybdopterin converting factor, subunit 2  64.29 
 
 
162 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1142  molybdopterin converting factor, subunit 2  64.29 
 
 
162 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0512781  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0026  molybdopterin converting factor, subunit 2  64.29 
 
 
162 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.204651  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1870  molybdopterin converting factor, subunit 2  64.29 
 
 
162 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0442  molybdopterin biosynthesis protein MoaE  66.67 
 
 
154 aa  218  3.9999999999999997e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0450  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  66.22 
 
 
175 aa  218  3.9999999999999997e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000102312  normal  0.705903 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2226  molybdopterin biosynthesis MoaE  64.05 
 
 
157 aa  218  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1547  molybdopterin synthase subunit MoaE  65.58 
 
 
165 aa  217  7.999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2551  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  66 
 
 
158 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3199  molybdopterin synthase subunit MoaE  66 
 
 
158 aa  212  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1248  molybdopterin synthase subunit MoaE  63.64 
 
 
172 aa  211  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.736844  hitchhiker  0.00601757 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1263  molybdopterin synthase subunit MoaE  64.86 
 
 
149 aa  209  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.228678 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1027  molybdopterin synthase subunit MoaE  65.54 
 
 
151 aa  207  5e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.877253  decreased coverage  0.00128032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5210  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  65.07 
 
 
153 aa  206  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.176681  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2523  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  67.14 
 
 
179 aa  200  7e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3627  molybdopterin biosynthesis MoaE  58.54 
 
 
169 aa  199  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0160  molybdopterin biosynthesis MoaE  62.59 
 
 
155 aa  194  5.000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000598821  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2202  molybdopterin converting factor, subunit 2  65.58 
 
 
166 aa  192  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00335655  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2196  molybdopterin synthase subunit MoaE  50.55 
 
 
188 aa  188  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00121089  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1249  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  59.46 
 
 
148 aa  180  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1069  molybdopterin biosynthesis MoaE  58.78 
 
 
149 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717042  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13250  molybdopterin converting factor, large subunit  55.41 
 
 
150 aa  175  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.934669  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2145  molybdopterin synthase subunit MoaE  54.97 
 
 
153 aa  174  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1192  molybdopterin converting factor large subunit  55.41 
 
 
150 aa  174  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.821537  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1036  molybdopterin synthase subunit MoaE  54.05 
 
 
150 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.960287 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2273  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  58.22 
 
 
146 aa  172  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3103  molybdopterin-converting factor subunit 2  56.76 
 
 
147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.231664  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1880  molybdopterin-converting factor subunit 2  55.48 
 
 
148 aa  169  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2167  molybdopterin biosynthesis MoaE  54.05 
 
 
148 aa  166  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0104  molybdopterin biosynthesis MoaE  52.7 
 
 
156 aa  164  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00530793  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0588  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  53.02 
 
 
163 aa  163  9e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.340802  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1294  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  58.78 
 
 
148 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.526565  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2077  molybdopterin synthase subunit MoaE  52.7 
 
 
152 aa  162  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000346647  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0966  molybdopterin biosynthesis MoaE  56.08 
 
 
150 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0548  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  53.42 
 
 
150 aa  160  6e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0477  molybdopterin biosynthesis MoaE  53.24 
 
 
148 aa  160  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4555  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  57.43 
 
 
148 aa  160  9e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4431  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  58.11 
 
 
148 aa  160  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.722423 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03857  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  50 
 
 
154 aa  159  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002958  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  54.79 
 
 
151 aa  159  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0901  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  57.43 
 
 
148 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246008  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3633  molybdopterin synthase subunit MoaE  57.72 
 
 
148 aa  159  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.218035 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3916  molybdopterin synthase subunit MoaE  50.68 
 
 
147 aa  158  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02950  hypothetical protein  53.42 
 
 
151 aa  158  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1324  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  57.53 
 
 
156 aa  158  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.557298  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2523  molybdopterin biosynthesis MoaE  50 
 
 
155 aa  157  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.271451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1724  molybdopterin synthase subunit MoaE  52.03 
 
 
154 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.849895  normal  0.129542 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1359  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  51.35 
 
 
155 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0976  molybdopterin converting factor, subunit 2  53.68 
 
 
164 aa  155  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1090  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  53.68 
 
 
164 aa  155  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1516  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  54.11 
 
 
150 aa  155  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1028  molybdopterin synthase subunit MoaE  52.03 
 
 
150 aa  155  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0955  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  54.86 
 
 
150 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00752  molybdopterin synthase, large subunit  55.4 
 
 
150 aa  152  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2857  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  55.4 
 
 
150 aa  152  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2858  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  55.4 
 
 
150 aa  152  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.629834  hitchhiker  0.00457417 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0869  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  54.86 
 
 
150 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196896  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0841  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  54.86 
 
 
150 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1278  molybdopterin biosynthesis MoaE  50.74 
 
 
155 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.271767 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00769  hypothetical protein  55.4 
 
 
150 aa  152  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2081  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  52.03 
 
 
149 aa  152  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.34736  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0085  molybdopterin biosynthesis MoaE  49.32 
 
 
156 aa  152  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0932  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  54.86 
 
 
150 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0808  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  55.4 
 
 
150 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00409432  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2815  molybdopterin synthase subunit MoaE  55.13 
 
 
162 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.818732  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3143  molybdopterin biosynthesis MoaE  48.65 
 
 
155 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.756812  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2155  molybdopterin biosynthesis MoaE  51.37 
 
 
154 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0839  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  55.4 
 
 
150 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0848  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  55.4 
 
 
150 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.337133  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0933  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  54.68 
 
 
150 aa  151  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2948  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  52.74 
 
 
150 aa  151  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.49271  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0900  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  54.86 
 
 
150 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1277  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  52.78 
 
 
150 aa  151  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.142074  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2522  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  54.79 
 
 
150 aa  150  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11280  Molybdopterin converting factor, large subunit  54.05 
 
 
148 aa  149  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481553  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2567  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  54.68 
 
 
150 aa  150  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.149869  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0276  molybdopterin synthase subunit MoaE  48.3 
 
 
155 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000334013 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0392  molybdopterin biosynthesis MoaE  49.66 
 
 
153 aa  149  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>