More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3143 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_3143  molybdopterin biosynthesis MoaE  100 
 
 
155 aa  313  5e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.756812  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2523  molybdopterin biosynthesis MoaE  90.26 
 
 
155 aa  289  1e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.271451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1724  molybdopterin synthase subunit MoaE  74.34 
 
 
154 aa  234  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.849895  normal  0.129542 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1359  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  72.73 
 
 
155 aa  234  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1174  molybdopterin biosynthesis MoaE  74.03 
 
 
155 aa  224  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398633  normal  0.371685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0904  molybdopterin biosynthesis MoaE  70.32 
 
 
152 aa  216  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1278  molybdopterin biosynthesis MoaE  71.43 
 
 
155 aa  216  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.271767 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2273  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  61.64 
 
 
146 aa  186  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0696  molybdopterin converting factor, subunit 2  56.49 
 
 
163 aa  185  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.289612  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0687  molybdopterin converting factor, subunit 2  55.84 
 
 
163 aa  183  9e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.962382  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1437  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  60.78 
 
 
169 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1978  molybdopterin synthase subunit MoaE  60.67 
 
 
154 aa  179  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2592  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  56.69 
 
 
155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.200448  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2260  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  59.87 
 
 
159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.467293  normal  0.604415 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0779  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  60.71 
 
 
156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.174082 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2077  molybdopterin synthase subunit MoaE  54.05 
 
 
152 aa  166  9e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000346647  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1027  molybdopterin synthase subunit MoaE  52.67 
 
 
151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.877253  decreased coverage  0.00128032 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1380  molybdopterin converting factor, subunit 2  51.7 
 
 
162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2392  molybdopterin converting factor, subunit 2  51.7 
 
 
162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1142  molybdopterin converting factor, subunit 2  51.7 
 
 
162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0512781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1870  molybdopterin converting factor, subunit 2  51.7 
 
 
162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0026  molybdopterin converting factor, subunit 2  51.7 
 
 
162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.204651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2265  molybdopterin converting factor, subunit 2  51.02 
 
 
162 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2227  molybdopterin converting factor, subunit 2  51.02 
 
 
162 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.137574  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1083  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  56.62 
 
 
153 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000999683 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2729  molybdopterin synthase subunit MoaE  53.33 
 
 
150 aa  159  9e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0618886  normal  0.244943 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1324  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  52.6 
 
 
156 aa  159  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.557298  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1249  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  52.7 
 
 
148 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1036  molybdopterin synthase subunit MoaE  50.67 
 
 
150 aa  159  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.960287 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6229  molybdopterin biosynthesis MoaE  53.06 
 
 
158 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1874  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  52.38 
 
 
158 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42646  hitchhiker  0.0000409453 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1850  molybdopterin biosynthesis MoaE  53.06 
 
 
158 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0442  molybdopterin biosynthesis protein MoaE  49.66 
 
 
154 aa  157  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1788  molybdopterin biosynthesis MoaE  52.38 
 
 
158 aa  157  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1760  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  51.7 
 
 
158 aa  157  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.242707 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1989  molybdopterin synthase subunit MoaE  51.35 
 
 
166 aa  157  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271107  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1228  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  59.54 
 
 
163 aa  156  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000515515 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0160  molybdopterin biosynthesis MoaE  50.32 
 
 
155 aa  156  8e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000598821  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1553  molybdopterin converting factor large subunit  56.74 
 
 
152 aa  156  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1423  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  51.7 
 
 
158 aa  155  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0306763  hitchhiker  0.00786823 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1192  molybdopterin converting factor large subunit  50.68 
 
 
150 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.821537  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1507  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  61.15 
 
 
153 aa  155  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.343988  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4116  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  51.35 
 
 
148 aa  155  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1786  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  61.15 
 
 
150 aa  154  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.748073  normal  0.0454659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1507  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  59.48 
 
 
150 aa  154  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547533  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5151  molybdopterin synthase subunit MoaE  50.34 
 
 
158 aa  154  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1750  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  68 
 
 
151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3627  molybdopterin biosynthesis MoaE  48.47 
 
 
169 aa  154  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1207  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  49.32 
 
 
173 aa  153  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0824978  normal  0.0611166 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1263  molybdopterin synthase subunit MoaE  49.32 
 
 
149 aa  153  7e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.228678 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1332  molybdopterin MPT converting factor subunit 2  51.02 
 
 
176 aa  153  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4789  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  49.66 
 
 
155 aa  153  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00106132  hitchhiker  0.000000156142 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0085  molybdopterin biosynthesis MoaE  48.67 
 
 
156 aa  153  8e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3103  molybdopterin-converting factor subunit 2  49.32 
 
 
147 aa  152  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.231664  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0450  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  47.02 
 
 
175 aa  152  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000102312  normal  0.705903 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1268  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  48.65 
 
 
173 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31619  normal  0.849988 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2815  molybdopterin synthase subunit MoaE  57.24 
 
 
162 aa  152  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.818732  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2522  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  49.66 
 
 
150 aa  152  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2523  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  51.77 
 
 
179 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1248  molybdopterin synthase subunit MoaE  50 
 
 
172 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.736844  hitchhiker  0.00601757 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2551  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  48.63 
 
 
158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4398  molybdopterin biosynthesis protein MoaE  50 
 
 
154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0259139  hitchhiker  0.000211704 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0280  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  49.34 
 
 
155 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3199  molybdopterin synthase subunit MoaE  48.63 
 
 
158 aa  150  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1277  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  52.74 
 
 
150 aa  150  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.142074  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0935  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  47.97 
 
 
158 aa  150  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.843261 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0104  molybdopterin biosynthesis MoaE  48.7 
 
 
156 aa  151  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00530793  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0284  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  49.34 
 
 
155 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0287  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  49.34 
 
 
155 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3745  molybdopterin synthase subunit MoaE  48.68 
 
 
155 aa  151  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0513249 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13250  molybdopterin converting factor, large subunit  49.32 
 
 
150 aa  150  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.934669  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0276  molybdopterin synthase subunit MoaE  48.68 
 
 
155 aa  150  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000334013 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0392  molybdopterin biosynthesis MoaE  48.68 
 
 
153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1962  molybdopterin synthase subunit MoaE  48.65 
 
 
163 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000171752  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4449  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  48.68 
 
 
155 aa  150  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0288  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  49.34 
 
 
155 aa  150  8e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1837  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  48.63 
 
 
158 aa  150  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0548  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  50 
 
 
150 aa  149  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1715  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  45.22 
 
 
159 aa  149  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.168291 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0091  molybdopterin biosynthesis MoaE  49.66 
 
 
155 aa  149  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.313658  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1069  molybdopterin biosynthesis MoaE  49.32 
 
 
149 aa  148  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717042  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1547  molybdopterin synthase subunit MoaE  51.37 
 
 
165 aa  149  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0277  molybdopterin synthase subunit MoaE  48.03 
 
 
155 aa  148  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000211309 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2226  molybdopterin biosynthesis MoaE  47.74 
 
 
157 aa  147  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209272 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0808  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  51.8 
 
 
150 aa  147  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00409432  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0848  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  51.8 
 
 
150 aa  147  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.337133  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2020  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  49.34 
 
 
159 aa  147  6e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00752  molybdopterin synthase, large subunit  51.8 
 
 
150 aa  147  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2857  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  51.8 
 
 
150 aa  147  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0933  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  51.08 
 
 
150 aa  147  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00769  hypothetical protein  51.8 
 
 
150 aa  147  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2858  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  51.8 
 
 
150 aa  147  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.629834  hitchhiker  0.00457417 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3528  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  48.65 
 
 
152 aa  146  9e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0900  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  51.77 
 
 
150 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0839  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  51.8 
 
 
150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2567  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  51.08 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.149869  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0955  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  51.06 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3633  molybdopterin synthase subunit MoaE  51.7 
 
 
148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.218035 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2347  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  60.71 
 
 
157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02950  hypothetical protein  47.97 
 
 
151 aa  145  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>