More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1174 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_1174  molybdopterin biosynthesis MoaE  100 
 
 
155 aa  311  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398633  normal  0.371685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1359  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  85.16 
 
 
155 aa  270  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1278  molybdopterin biosynthesis MoaE  93.57 
 
 
155 aa  266  7e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.271767 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3143  molybdopterin biosynthesis MoaE  74.03 
 
 
155 aa  248  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.756812  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2523  molybdopterin biosynthesis MoaE  72.73 
 
 
155 aa  244  4e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.271451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1724  molybdopterin synthase subunit MoaE  70.78 
 
 
154 aa  229  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.849895  normal  0.129542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0904  molybdopterin biosynthesis MoaE  72.08 
 
 
152 aa  217  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2273  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  62.33 
 
 
146 aa  192  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0696  molybdopterin converting factor, subunit 2  56.13 
 
 
163 aa  183  7e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.289612  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0687  molybdopterin converting factor, subunit 2  56.13 
 
 
163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.962382  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1437  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  56.49 
 
 
169 aa  174  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2592  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  57.05 
 
 
155 aa  169  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.200448  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1027  molybdopterin synthase subunit MoaE  54.67 
 
 
151 aa  169  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.877253  decreased coverage  0.00128032 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1978  molybdopterin synthase subunit MoaE  54.49 
 
 
154 aa  168  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6229  molybdopterin biosynthesis MoaE  56.46 
 
 
158 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1850  molybdopterin biosynthesis MoaE  56.46 
 
 
158 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1874  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  55.78 
 
 
158 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42646  hitchhiker  0.0000409453 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0779  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  60 
 
 
156 aa  166  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.174082 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1788  molybdopterin biosynthesis MoaE  56.46 
 
 
158 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1760  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  55.78 
 
 
158 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.242707 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1989  molybdopterin synthase subunit MoaE  53.38 
 
 
166 aa  164  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271107  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1423  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  54.42 
 
 
158 aa  163  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0306763  hitchhiker  0.00786823 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5151  molybdopterin synthase subunit MoaE  54.42 
 
 
158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2077  molybdopterin synthase subunit MoaE  52.7 
 
 
152 aa  161  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000346647  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0160  molybdopterin biosynthesis MoaE  49.68 
 
 
155 aa  160  8.000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000598821  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0442  molybdopterin biosynthesis protein MoaE  50.68 
 
 
154 aa  159  9e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1207  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  50 
 
 
173 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0824978  normal  0.0611166 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1332  molybdopterin MPT converting factor subunit 2  52.38 
 
 
176 aa  159  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2260  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  57.23 
 
 
159 aa  159  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.467293  normal  0.604415 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2729  molybdopterin synthase subunit MoaE  51.33 
 
 
150 aa  159  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0618886  normal  0.244943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13250  molybdopterin converting factor, large subunit  51.33 
 
 
150 aa  158  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.934669  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1268  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  49.32 
 
 
173 aa  157  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31619  normal  0.849988 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1962  molybdopterin synthase subunit MoaE  51.35 
 
 
163 aa  157  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000171752  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1192  molybdopterin converting factor large subunit  51.33 
 
 
150 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.821537  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0450  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  48 
 
 
175 aa  153  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000102312  normal  0.705903 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1036  molybdopterin synthase subunit MoaE  47.33 
 
 
150 aa  153  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.960287 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1249  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  50 
 
 
148 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2815  molybdopterin synthase subunit MoaE  54.55 
 
 
162 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.818732  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3103  molybdopterin-converting factor subunit 2  51.01 
 
 
147 aa  150  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.231664  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2265  molybdopterin converting factor, subunit 2  49.66 
 
 
162 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2227  molybdopterin converting factor, subunit 2  49.66 
 
 
162 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.137574  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2522  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  49.66 
 
 
150 aa  149  8.999999999999999e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1786  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  60.74 
 
 
150 aa  149  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.748073  normal  0.0454659 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1507  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  60.74 
 
 
153 aa  149  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.343988  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1380  molybdopterin converting factor, subunit 2  48.98 
 
 
162 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0026  molybdopterin converting factor, subunit 2  48.98 
 
 
162 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.204651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2392  molybdopterin converting factor, subunit 2  48.98 
 
 
162 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1142  molybdopterin converting factor, subunit 2  48.98 
 
 
162 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0512781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1870  molybdopterin converting factor, subunit 2  48.98 
 
 
162 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1324  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  48.7 
 
 
156 aa  149  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.557298  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1263  molybdopterin synthase subunit MoaE  45.64 
 
 
149 aa  149  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.228678 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1553  molybdopterin converting factor large subunit  55.48 
 
 
152 aa  148  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0935  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  47.3 
 
 
158 aa  148  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.843261 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2347  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  62.14 
 
 
157 aa  147  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1507  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  60 
 
 
150 aa  147  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547533  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1069  molybdopterin biosynthesis MoaE  47.65 
 
 
149 aa  147  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717042  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2523  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  48.94 
 
 
179 aa  147  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4116  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  50 
 
 
148 aa  147  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1750  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  60.26 
 
 
151 aa  146  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0955  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  48.63 
 
 
150 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0085  molybdopterin biosynthesis MoaE  47.33 
 
 
156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1810  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  47.26 
 
 
158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131712  normal  0.0769758 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1837  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  48.63 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4789  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  48.65 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00106132  hitchhiker  0.000000156142 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1277  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  48.63 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.142074  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1228  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  55.38 
 
 
163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000515515 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1715  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  45.45 
 
 
159 aa  144  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.168291 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0548  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  47.26 
 
 
150 aa  144  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0900  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  48.63 
 
 
150 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0932  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  48.63 
 
 
150 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0841  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  48.63 
 
 
150 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1083  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  51.85 
 
 
153 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000999683 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2226  molybdopterin biosynthesis MoaE  46.71 
 
 
157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209272 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2377  molybdopterin synthase subunit MoaE  47.26 
 
 
158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0869  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  48.63 
 
 
150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196896  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3627  molybdopterin biosynthesis MoaE  46.01 
 
 
169 aa  144  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0808  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  47.95 
 
 
150 aa  144  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00409432  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2020  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  48.68 
 
 
159 aa  144  6e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0966  molybdopterin biosynthesis MoaE  52.7 
 
 
150 aa  144  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0104  molybdopterin biosynthesis MoaE  44.81 
 
 
156 aa  144  6e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00530793  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3745  molybdopterin synthase subunit MoaE  46.41 
 
 
155 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0513249 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1248  molybdopterin synthase subunit MoaE  50 
 
 
172 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.736844  hitchhiker  0.00601757 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4449  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  46.41 
 
 
155 aa  143  9e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0276  molybdopterin synthase subunit MoaE  46.41 
 
 
155 aa  143  9e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000334013 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00752  molybdopterin synthase, large subunit  47.26 
 
 
150 aa  143  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2857  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  47.26 
 
 
150 aa  142  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2858  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  47.26 
 
 
150 aa  142  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.629834  hitchhiker  0.00457417 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0848  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  47.26 
 
 
150 aa  143  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.337133  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00769  hypothetical protein  47.26 
 
 
150 aa  143  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0933  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  46.58 
 
 
150 aa  142  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4398  molybdopterin biosynthesis protein MoaE  47.97 
 
 
154 aa  142  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0259139  hitchhiker  0.000211704 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0091  molybdopterin biosynthesis MoaE  49.32 
 
 
155 aa  142  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.313658  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5210  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  47.3 
 
 
153 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.176681  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0839  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  47.26 
 
 
150 aa  142  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1880  molybdopterin-converting factor subunit 2  45.95 
 
 
148 aa  142  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1437  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  48.63 
 
 
150 aa  141  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2833  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  48.63 
 
 
151 aa  141  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.655624  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2919  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  48.63 
 
 
151 aa  141  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.167832  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0392  molybdopterin biosynthesis MoaE  47.06 
 
 
153 aa  141  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2567  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  47.26 
 
 
150 aa  141  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.149869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>