More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0104 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0104  molybdopterin biosynthesis MoaE  100 
 
 
156 aa  325  1.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00530793  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3528  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  70.27 
 
 
152 aa  226  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4789  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  66.23 
 
 
155 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00106132  hitchhiker  0.000000156142 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0091  molybdopterin biosynthesis MoaE  66.22 
 
 
155 aa  215  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.313658  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0392  molybdopterin biosynthesis MoaE  67.12 
 
 
153 aa  215  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0288  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  68.49 
 
 
155 aa  214  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4398  molybdopterin biosynthesis protein MoaE  66.22 
 
 
154 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0259139  hitchhiker  0.000211704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0287  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  67.81 
 
 
155 aa  214  5e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0284  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  67.81 
 
 
155 aa  214  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0276  molybdopterin synthase subunit MoaE  66.44 
 
 
155 aa  213  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000334013 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0280  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  67.81 
 
 
155 aa  213  8e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4449  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  67.12 
 
 
155 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3745  molybdopterin synthase subunit MoaE  67.81 
 
 
155 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0513249 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0085  molybdopterin biosynthesis MoaE  66 
 
 
156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4116  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  66.67 
 
 
148 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0277  molybdopterin synthase subunit MoaE  65.77 
 
 
155 aa  209  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000211309 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2167  molybdopterin biosynthesis MoaE  58.22 
 
 
148 aa  182  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1324  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  55.56 
 
 
156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.557298  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1880  molybdopterin-converting factor subunit 2  56.46 
 
 
148 aa  182  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002958  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  56.08 
 
 
151 aa  180  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1277  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  53.69 
 
 
150 aa  180  7e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.142074  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02950  hypothetical protein  56.08 
 
 
151 aa  180  8.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0548  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  54.42 
 
 
150 aa  179  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0955  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  54.05 
 
 
150 aa  177  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0933  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  53.69 
 
 
150 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2857  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  53.02 
 
 
150 aa  176  9e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2858  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  53.02 
 
 
150 aa  176  9e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.629834  hitchhiker  0.00457417 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0848  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  53.02 
 
 
150 aa  176  9e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.337133  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0839  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  53.02 
 
 
150 aa  176  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0808  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  52.35 
 
 
150 aa  176  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00409432  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1263  molybdopterin synthase subunit MoaE  55.78 
 
 
149 aa  176  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.228678 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0841  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  53.38 
 
 
150 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0932  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  53.38 
 
 
150 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2567  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  52.35 
 
 
150 aa  174  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.149869  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00752  molybdopterin synthase, large subunit  52.35 
 
 
150 aa  174  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0900  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  53.38 
 
 
150 aa  174  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0869  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  53.38 
 
 
150 aa  174  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196896  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00769  hypothetical protein  52.35 
 
 
150 aa  174  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2522  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  54.05 
 
 
150 aa  173  7e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2919  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  52.98 
 
 
151 aa  173  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.167832  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2833  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  52.98 
 
 
151 aa  173  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.655624  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1516  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  53.38 
 
 
150 aa  173  8e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1437  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  54.11 
 
 
150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2729  molybdopterin synthase subunit MoaE  54 
 
 
150 aa  171  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0618886  normal  0.244943 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1249  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  54.05 
 
 
148 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2523  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  54.61 
 
 
179 aa  170  7.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2948  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  52.35 
 
 
150 aa  169  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.49271  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1027  molybdopterin synthase subunit MoaE  52 
 
 
151 aa  168  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.877253  decreased coverage  0.00128032 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0450  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  54 
 
 
175 aa  167  6e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000102312  normal  0.705903 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03857  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  50 
 
 
154 aa  167  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1207  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  52.03 
 
 
173 aa  164  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0824978  normal  0.0611166 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1332  molybdopterin MPT converting factor subunit 2  54.79 
 
 
176 aa  164  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1268  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  52.7 
 
 
173 aa  164  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31619  normal  0.849988 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4638  molybdopterin converting factor, subunit 2  54.25 
 
 
156 aa  163  6.9999999999999995e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0442  molybdopterin biosynthesis protein MoaE  52.35 
 
 
154 aa  163  9e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13250  molybdopterin converting factor, large subunit  50.67 
 
 
150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.934669  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1192  molybdopterin converting factor large subunit  50 
 
 
150 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.821537  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1069  molybdopterin biosynthesis MoaE  51.01 
 
 
149 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717042  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2155  molybdopterin biosynthesis MoaE  51.33 
 
 
154 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1547  molybdopterin synthase subunit MoaE  51.02 
 
 
165 aa  159  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1989  molybdopterin synthase subunit MoaE  50.68 
 
 
166 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271107  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0026  molybdopterin converting factor, subunit 2  51.37 
 
 
162 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.204651  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1380  molybdopterin converting factor, subunit 2  51.37 
 
 
162 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1142  molybdopterin converting factor, subunit 2  51.37 
 
 
162 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0512781  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2392  molybdopterin converting factor, subunit 2  51.37 
 
 
162 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1870  molybdopterin converting factor, subunit 2  51.37 
 
 
162 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1036  molybdopterin synthase subunit MoaE  49.33 
 
 
150 aa  157  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.960287 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2610  GntR family transcriptional regulator  54.79 
 
 
145 aa  157  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.384638  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2227  molybdopterin converting factor, subunit 2  50.68 
 
 
162 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.137574  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1028  molybdopterin synthase subunit MoaE  47.62 
 
 
150 aa  157  5e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2265  molybdopterin converting factor, subunit 2  50.68 
 
 
162 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2431  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  54.05 
 
 
149 aa  157  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.682731  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2077  molybdopterin synthase subunit MoaE  48.99 
 
 
152 aa  155  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000346647  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2020  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  51.02 
 
 
159 aa  155  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1423  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  50.68 
 
 
158 aa  154  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0306763  hitchhiker  0.00786823 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0477  molybdopterin biosynthesis MoaE  49.66 
 
 
148 aa  154  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0935  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  50 
 
 
158 aa  154  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.843261 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2145  molybdopterin synthase subunit MoaE  49.67 
 
 
153 aa  154  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1962  molybdopterin synthase subunit MoaE  49.32 
 
 
163 aa  154  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000171752  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1874  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  49.32 
 
 
158 aa  153  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42646  hitchhiker  0.0000409453 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5151  molybdopterin synthase subunit MoaE  48.63 
 
 
158 aa  152  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6229  molybdopterin biosynthesis MoaE  49.32 
 
 
158 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1850  molybdopterin biosynthesis MoaE  49.32 
 
 
158 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1760  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  48.63 
 
 
158 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.242707 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1810  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  47.97 
 
 
158 aa  152  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131712  normal  0.0769758 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1837  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  48.98 
 
 
158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1788  molybdopterin biosynthesis MoaE  48.63 
 
 
158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3143  molybdopterin biosynthesis MoaE  48.7 
 
 
155 aa  151  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.756812  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2226  molybdopterin biosynthesis MoaE  48.3 
 
 
157 aa  151  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209272 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1917  molybdopterin biosynthesis MoaE  49.66 
 
 
163 aa  150  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.925858  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2377  molybdopterin synthase subunit MoaE  48.65 
 
 
158 aa  150  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5210  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  47.65 
 
 
153 aa  150  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.176681  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2523  molybdopterin biosynthesis MoaE  48.05 
 
 
155 aa  150  8e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.271451 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2551  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  47.62 
 
 
158 aa  149  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1248  molybdopterin synthase subunit MoaE  46.98 
 
 
172 aa  148  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.736844  hitchhiker  0.00601757 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3199  molybdopterin synthase subunit MoaE  47.62 
 
 
158 aa  148  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0966  molybdopterin biosynthesis MoaE  50.68 
 
 
150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1294  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  51.35 
 
 
148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.526565  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3627  molybdopterin biosynthesis MoaE  46.84 
 
 
169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4431  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  51.37 
 
 
148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.722423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>