More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1090 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0976  molybdopterin converting factor, subunit 2  100 
 
 
164 aa  341  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1090  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  100 
 
 
164 aa  341  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1207  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  54.41 
 
 
173 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0824978  normal  0.0611166 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1962  molybdopterin synthase subunit MoaE  58.82 
 
 
163 aa  156  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000171752  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2020  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  57.46 
 
 
159 aa  155  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1268  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  53.68 
 
 
173 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31619  normal  0.849988 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1989  molybdopterin synthase subunit MoaE  58.09 
 
 
166 aa  155  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271107  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0442  molybdopterin biosynthesis protein MoaE  52.94 
 
 
154 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1874  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  51.3 
 
 
158 aa  150  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42646  hitchhiker  0.0000409453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6229  molybdopterin biosynthesis MoaE  51.3 
 
 
158 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1788  molybdopterin biosynthesis MoaE  49.68 
 
 
158 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1850  molybdopterin biosynthesis MoaE  51.3 
 
 
158 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5151  molybdopterin synthase subunit MoaE  49.68 
 
 
158 aa  149  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1248  molybdopterin synthase subunit MoaE  51.3 
 
 
172 aa  149  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.736844  hitchhiker  0.00601757 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1760  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  50 
 
 
158 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.242707 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1495  molybdopterin synthase subunit MoaE  47.17 
 
 
372 aa  147  8e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00326652 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1332  molybdopterin MPT converting factor subunit 2  52.24 
 
 
176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1423  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  53.73 
 
 
158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0306763  hitchhiker  0.00786823 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0160  molybdopterin biosynthesis MoaE  54.41 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000598821  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13250  molybdopterin converting factor, large subunit  52.21 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.934669  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1837  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  52.24 
 
 
158 aa  145  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3055  molybdopterin converting factor, subunit 2  48.55 
 
 
151 aa  143  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1036  molybdopterin synthase subunit MoaE  52.21 
 
 
150 aa  143  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.960287 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1192  molybdopterin converting factor large subunit  52.21 
 
 
150 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.821537  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3916  molybdopterin synthase subunit MoaE  52.21 
 
 
147 aa  142  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2729  molybdopterin synthase subunit MoaE  54.01 
 
 
150 aa  142  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0618886  normal  0.244943 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5210  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  52.24 
 
 
153 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.176681  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2952  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  51.45 
 
 
144 aa  141  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1069  molybdopterin biosynthesis MoaE  52.21 
 
 
149 aa  140  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717042  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3627  molybdopterin biosynthesis MoaE  49.66 
 
 
169 aa  140  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0450  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  50.36 
 
 
175 aa  140  8e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000102312  normal  0.705903 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0935  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  51.47 
 
 
158 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.843261 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1547  molybdopterin synthase subunit MoaE  50.75 
 
 
165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2523  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  50.75 
 
 
179 aa  138  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2551  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  50.75 
 
 
158 aa  139  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3199  molybdopterin synthase subunit MoaE  50.75 
 
 
158 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1380  molybdopterin converting factor, subunit 2  52.24 
 
 
162 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1870  molybdopterin converting factor, subunit 2  52.24 
 
 
162 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2392  molybdopterin converting factor, subunit 2  52.24 
 
 
162 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1917  molybdopterin biosynthesis MoaE  51.47 
 
 
163 aa  136  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.925858  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1263  molybdopterin synthase subunit MoaE  47.79 
 
 
149 aa  136  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.228678 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03857  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  47.79 
 
 
154 aa  136  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0026  molybdopterin converting factor, subunit 2  52.24 
 
 
162 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.204651  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2226  molybdopterin biosynthesis MoaE  50 
 
 
157 aa  136  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209272 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1142  molybdopterin converting factor, subunit 2  52.24 
 
 
162 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0512781  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1249  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  47.62 
 
 
148 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2265  molybdopterin converting factor, subunit 2  51.49 
 
 
162 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2227  molybdopterin converting factor, subunit 2  51.49 
 
 
162 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.137574  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1027  molybdopterin synthase subunit MoaE  50 
 
 
151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.877253  decreased coverage  0.00128032 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2377  molybdopterin synthase subunit MoaE  50.74 
 
 
158 aa  134  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1810  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  47.1 
 
 
158 aa  134  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131712  normal  0.0769758 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2273  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  51.11 
 
 
146 aa  133  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0966  molybdopterin biosynthesis MoaE  52.94 
 
 
150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0588  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  49.64 
 
 
163 aa  131  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.340802  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2202  molybdopterin converting factor, subunit 2  51.49 
 
 
166 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00335655  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3633  molybdopterin synthase subunit MoaE  52.55 
 
 
148 aa  129  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.218035 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0477  molybdopterin biosynthesis MoaE  46.67 
 
 
148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3103  molybdopterin-converting factor subunit 2  49.26 
 
 
147 aa  127  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.231664  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1880  molybdopterin-converting factor subunit 2  45.93 
 
 
148 aa  127  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2145  molybdopterin synthase subunit MoaE  48.53 
 
 
153 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2480  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  47.92 
 
 
145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4555  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  52.94 
 
 
148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4431  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  52.94 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.722423 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2196  molybdopterin synthase subunit MoaE  42.68 
 
 
188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00121089  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1294  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  52.94 
 
 
148 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.526565  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0901  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  52.94 
 
 
148 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246008  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2610  GntR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
145 aa  124  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.384638  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02950  hypothetical protein  47.76 
 
 
151 aa  123  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0548  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  45.52 
 
 
150 aa  123  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2815  molybdopterin synthase subunit MoaE  55.4 
 
 
162 aa  123  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.818732  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0085  molybdopterin biosynthesis MoaE  45.59 
 
 
156 aa  123  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4449  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  47.01 
 
 
155 aa  122  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0276  molybdopterin synthase subunit MoaE  47.01 
 
 
155 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000334013 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3745  molybdopterin synthase subunit MoaE  47.01 
 
 
155 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0513249 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1553  molybdopterin converting factor large subunit  45.26 
 
 
152 aa  122  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0104  molybdopterin biosynthesis MoaE  46.27 
 
 
156 aa  122  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00530793  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2077  molybdopterin synthase subunit MoaE  54.55 
 
 
152 aa  122  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000346647  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002958  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  47.01 
 
 
151 aa  121  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4116  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  45.19 
 
 
148 aa  121  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1724  molybdopterin synthase subunit MoaE  47.01 
 
 
154 aa  120  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.849895  normal  0.129542 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11280  Molybdopterin converting factor, large subunit  51.47 
 
 
148 aa  120  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481553  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1516  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  52.29 
 
 
150 aa  120  9e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0091  molybdopterin biosynthesis MoaE  47.01 
 
 
155 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.313658  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4398  molybdopterin biosynthesis protein MoaE  47.01 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0259139  hitchhiker  0.000211704 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0955  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  51.38 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0869  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  51.38 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196896  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1228  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  46.92 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000515515 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0277  molybdopterin synthase subunit MoaE  46.27 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000211309 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4789  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  45.52 
 
 
155 aa  118  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00106132  hitchhiker  0.000000156142 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0900  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  51.38 
 
 
150 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0932  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  51.38 
 
 
150 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0779  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  47.69 
 
 
156 aa  118  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.174082 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0841  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  51.38 
 
 
150 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00752  molybdopterin synthase, large subunit  50.46 
 
 
150 aa  117  7e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00769  hypothetical protein  50.46 
 
 
150 aa  117  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1715  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  47.62 
 
 
159 aa  117  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.168291 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2167  molybdopterin biosynthesis MoaE  40.15 
 
 
148 aa  117  9e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2857  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  50.46 
 
 
150 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0848  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  50.46 
 
 
150 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.337133  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0839  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  50.46 
 
 
150 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>