12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1647 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1647  hypothetical protein  100 
 
 		 1491 aa  2997    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3753  hypothetical protein  39.44 
 
 		 1503 aa  979    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2906  hypothetical protein  30.41 
 
 		 1530 aa  548  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1043  hypothetical protein  35.03 
 
 		 1574 aa  485  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5015  AAA ATPase  29.37 
 
 		 1496 aa  440  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.940006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2260  hypothetical protein  25.59 
 
 		 1231 aa  273  1e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4166  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1386 aa  231  7e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.748041  normal  0.743338 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0325  hypothetical protein  23.96 
 
 		 1411 aa  211  9e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.751077  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0840  hypothetical protein  20.69 
 
 		 1343 aa  92.8  5e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0269599 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3307  hypothetical protein  20.43 
 
 		 929 aa  52.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1488  hypothetical protein  25.95 
 
 		 492 aa  47  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.804082 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26370  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1263 aa  46.6  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0321246  normal  0.0352577 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>