10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2906 on replicon NC_013502
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1043  hypothetical protein  48.44 
 
 		 1574 aa  1492    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2906  hypothetical protein  100 
 
 		 1530 aa  3154    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3753  hypothetical protein  30.96 
 
 		 1503 aa  605  1.0000000000000001e-171  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1647  hypothetical protein  30.28 
 
 		 1491 aa  553  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5015  AAA ATPase  28.61 
 
 		 1496 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.940006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2260  hypothetical protein  30.72 
 
 		 1231 aa  438  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0325  hypothetical protein  30.26 
 
 		 1411 aa  269  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.751077  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4166  hypothetical protein  27.12 
 
 		 1386 aa  264  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.748041  normal  0.743338 
 
 
-
 
NC_002950  PG0840  hypothetical protein  24.96 
 
 		 1343 aa  151  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0269599 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26370  hypothetical protein  22.78 
 
 		 1263 aa  46.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0321246  normal  0.0352577 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>