9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4166 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4166  hypothetical protein  100 
 
 		 1386 aa  2847    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.748041  normal  0.743338 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2906  hypothetical protein  27.02 
 
 		 1530 aa  261  8e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3753  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1503 aa  254  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1043  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1574 aa  247  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2260  hypothetical protein  25.58 
 
 		 1231 aa  244  1e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1647  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1491 aa  227  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5015  AAA ATPase  24.62 
 
 		 1496 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.940006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0325  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1411 aa  163  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.751077  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0840  hypothetical protein  23.2 
 
 		 1343 aa  86.7  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0269599 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>