10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_5015 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_5015  AAA ATPase  100 
 
 		 1496 aa  3088    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.940006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3753  hypothetical protein  29.97 
 
 		 1503 aa  501  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1647  hypothetical protein  29.3 
 
 		 1491 aa  463  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2906  hypothetical protein  28.61 
 
 		 1530 aa  452  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1043  hypothetical protein  28.75 
 
 		 1574 aa  435  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2260  hypothetical protein  27.57 
 
 		 1231 aa  305  3.0000000000000004e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4166  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1386 aa  207  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.748041  normal  0.743338 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0325  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1411 aa  199  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.751077  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0840  hypothetical protein  21.92 
 
 		 1343 aa  101  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0269599 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26370  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1263 aa  67.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0321246  normal  0.0352577 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>