22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1278 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1278  sulfotransferase  100 
 
 
277 aa  566  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0057  sulfotransferase  38.49 
 
 
278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1463  sulfotransferase  41.18 
 
 
280 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3027  sulfotransferase  42.55 
 
 
288 aa  177  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1354  sulfotransferase  36.69 
 
 
289 aa  172  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0854  sulfotransferase  33.09 
 
 
299 aa  145  9e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0517  sulfotransferase  34.64 
 
 
274 aa  142  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.485393  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0572  hypothetical protein  31.91 
 
 
348 aa  142  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0789  sulfotransferase  32.29 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0857  sulfotransferase  35.51 
 
 
289 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129713  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2689  sulfotransferase  31.56 
 
 
281 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.184412 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1283  sulfotransferase  32.75 
 
 
293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27001  hypothetical protein  29.18 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0935  sulfotransferase  25.09 
 
 
279 aa  63.5  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016452 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1549  sulfotransferase  25.09 
 
 
258 aa  58.9  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4186  sulfotransferase  24.25 
 
 
324 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.593585  normal  0.326163 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0779  sulfotransferase  22.61 
 
 
258 aa  49.7  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4140  sulfotransferase  22.1 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.888871 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4582  sulfotransferase  26.69 
 
 
280 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1164  sulfotransferase family protein  22.13 
 
 
210 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3111  sulfotransferase  25.53 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0085  sulfotransferase  20.52 
 
 
287 aa  43.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.139736 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>