42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0854 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0854  sulfotransferase  100 
 
 
299 aa  598  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0057  sulfotransferase  39.07 
 
 
278 aa  185  9e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1354  sulfotransferase  36.88 
 
 
289 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0857  sulfotransferase  43.1 
 
 
289 aa  170  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129713  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1463  sulfotransferase  38.68 
 
 
280 aa  165  9e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2689  sulfotransferase  31.58 
 
 
281 aa  155  7e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.184412 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0789  sulfotransferase  31.21 
 
 
280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3027  sulfotransferase  36.93 
 
 
288 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0517  sulfotransferase  35.84 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.485393  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1278  sulfotransferase  33.09 
 
 
277 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1283  sulfotransferase  33.33 
 
 
293 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27001  hypothetical protein  31.6 
 
 
293 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0572  hypothetical protein  31.47 
 
 
348 aa  138  8.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0935  sulfotransferase  24.75 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016452 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3104  sulfotransferase  34.22 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1549  sulfotransferase  27.3 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5094  sulfotransferase  24.83 
 
 
317 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3105  sulfotransferase  26.67 
 
 
388 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1825  sulfotransferase  23.66 
 
 
302 aa  64.3  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.497043 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0779  sulfotransferase  25.19 
 
 
258 aa  63.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2745  sulfotransferase  27.66 
 
 
314 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.486823  hitchhiker  0.00314682 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7152  sulfotransferase  25.42 
 
 
312 aa  59.3  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2110  sulfotransferase  23 
 
 
297 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16705  normal  0.845764 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3812  sulfotransferase  22.63 
 
 
244 aa  56.2  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.946328  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04340  sulfotransferase  27.08 
 
 
310 aa  55.8  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2304  sulfotransferase  22.46 
 
 
308 aa  53.5  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.864623  normal  0.10354 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4582  sulfotransferase  24.07 
 
 
280 aa  52.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3976  hypothetical protein  30.6 
 
 
308 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2372  sulfotransferase  25.36 
 
 
319 aa  52  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3111  sulfotransferase  30.51 
 
 
329 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4186  sulfotransferase  23.14 
 
 
324 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.593585  normal  0.326163 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2350  sulfotransferase  21.9 
 
 
250 aa  49.3  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0082  sulfotransferase  23.45 
 
 
300 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4140  sulfotransferase  23.53 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.888871 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1933  sulfotransferase-like protein  31.25 
 
 
347 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.345912  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3108  sulfotransferase  29.79 
 
 
370 aa  46.6  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0691  sulfotransferase  35.65 
 
 
269 aa  47  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3034  sulfotransferase family protein  23.53 
 
 
229 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1720  sulfotransferase  28.26 
 
 
289 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192631  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
1037 aa  42.7  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1130  hypothetical protein  21.92 
 
 
313 aa  42.7  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585084  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  28.7 
 
 
711 aa  42.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>