28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0789 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_0789  sulfotransferase  100 
 
 
280 aa  588  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2689  sulfotransferase  76.87 
 
 
281 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.184412 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1283  sulfotransferase  49.28 
 
 
293 aa  280  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0517  sulfotransferase  44.6 
 
 
274 aa  231  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.485393  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0572  hypothetical protein  43.57 
 
 
348 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1354  sulfotransferase  38.38 
 
 
289 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0057  sulfotransferase  38.73 
 
 
278 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1463  sulfotransferase  35.82 
 
 
280 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0854  sulfotransferase  31.21 
 
 
299 aa  153  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3027  sulfotransferase  37.37 
 
 
288 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1278  sulfotransferase  32.29 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0857  sulfotransferase  33.82 
 
 
289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129713  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27001  hypothetical protein  30.42 
 
 
293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0935  sulfotransferase  23.84 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016452 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1549  sulfotransferase  23.4 
 
 
258 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0085  sulfotransferase  23.33 
 
 
287 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.139736 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4140  sulfotransferase  23.72 
 
 
243 aa  56.6  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.888871 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1291  sulfotransferase  23.96 
 
 
290 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1164  sulfotransferase family protein  22.34 
 
 
210 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0779  sulfotransferase  24.71 
 
 
258 aa  52.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2155  Alcohol sulfotransferase  21.85 
 
 
272 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2217  Alcohol sulfotransferase  21.85 
 
 
287 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.116061 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3104  sulfotransferase  24.04 
 
 
368 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4186  sulfotransferase  22.34 
 
 
324 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.593585  normal  0.326163 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3108  sulfotransferase  29.25 
 
 
370 aa  47.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1825  sulfotransferase  22.06 
 
 
302 aa  43.9  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.497043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1208  hypothetical protein  23.35 
 
 
347 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3105  sulfotransferase  24.58 
 
 
388 aa  42.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>