34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2689 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_2689  sulfotransferase  100 
 
 
281 aa  592  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.184412 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0789  sulfotransferase  76.87 
 
 
280 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1283  sulfotransferase  46.62 
 
 
293 aa  268  7e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0517  sulfotransferase  45.49 
 
 
274 aa  231  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.485393  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0572  hypothetical protein  40.93 
 
 
348 aa  212  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1354  sulfotransferase  37.72 
 
 
289 aa  185  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0057  sulfotransferase  39.5 
 
 
278 aa  185  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3027  sulfotransferase  37.01 
 
 
288 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0854  sulfotransferase  31.58 
 
 
299 aa  155  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1463  sulfotransferase  33.57 
 
 
280 aa  149  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0857  sulfotransferase  34.89 
 
 
289 aa  145  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129713  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27001  hypothetical protein  30.82 
 
 
293 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1278  sulfotransferase  31.56 
 
 
277 aa  132  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0935  sulfotransferase  26.26 
 
 
279 aa  90.1  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016452 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1549  sulfotransferase  23.69 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4140  sulfotransferase  25.71 
 
 
243 aa  63.2  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.888871 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0779  sulfotransferase  24.44 
 
 
258 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1164  sulfotransferase family protein  24.26 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1825  sulfotransferase  23.24 
 
 
302 aa  55.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.497043 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4582  sulfotransferase  22.34 
 
 
280 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4186  sulfotransferase  23.36 
 
 
324 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.593585  normal  0.326163 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3108  sulfotransferase  28.35 
 
 
370 aa  53.1  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3105  sulfotransferase  29.47 
 
 
388 aa  53.1  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6174  sulfotransferase  25.56 
 
 
296 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3104  sulfotransferase  24.59 
 
 
368 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2304  sulfotransferase  22.5 
 
 
308 aa  50.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.864623  normal  0.10354 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2155  Alcohol sulfotransferase  22.91 
 
 
272 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2217  Alcohol sulfotransferase  22.91 
 
 
287 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.116061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0085  sulfotransferase  24.44 
 
 
287 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.139736 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3812  sulfotransferase  20 
 
 
244 aa  47  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.946328  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1291  sulfotransferase  23.2 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0484  sulfotransferase  25.22 
 
 
314 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.948459  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0082  sulfotransferase  19.93 
 
 
300 aa  43.5  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2745  sulfotransferase  23.4 
 
 
314 aa  42.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.486823  hitchhiker  0.00314682 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>