32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0572 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0572  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  726    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1283  sulfotransferase  40.22 
 
 
293 aa  217  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0789  sulfotransferase  43.57 
 
 
280 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2689  sulfotransferase  40.93 
 
 
281 aa  212  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.184412 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0517  sulfotransferase  42.6 
 
 
274 aa  199  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.485393  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0057  sulfotransferase  38.21 
 
 
278 aa  177  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1354  sulfotransferase  35.17 
 
 
289 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3027  sulfotransferase  35.64 
 
 
288 aa  155  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1463  sulfotransferase  34.71 
 
 
280 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27001  hypothetical protein  34.86 
 
 
293 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1278  sulfotransferase  31.91 
 
 
277 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0854  sulfotransferase  31.47 
 
 
299 aa  138  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0857  sulfotransferase  34.04 
 
 
289 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129713  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2217  Alcohol sulfotransferase  27.24 
 
 
287 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.116061 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2155  Alcohol sulfotransferase  27.24 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0085  sulfotransferase  27.62 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.139736 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0935  sulfotransferase  22.86 
 
 
279 aa  65.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016452 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1291  sulfotransferase  23.13 
 
 
290 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4186  sulfotransferase  24.75 
 
 
324 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.593585  normal  0.326163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1549  sulfotransferase  24.64 
 
 
258 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0484  sulfotransferase  23.89 
 
 
314 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.948459  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3108  sulfotransferase  29.53 
 
 
370 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4140  sulfotransferase  25.17 
 
 
243 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.888871 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3105  sulfotransferase  25.95 
 
 
388 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2110  sulfotransferase  23.15 
 
 
297 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16705  normal  0.845764 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4582  sulfotransferase  23.7 
 
 
280 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1164  sulfotransferase family protein  21.09 
 
 
210 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3104  sulfotransferase  25.12 
 
 
368 aa  50.8  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45258  predicted protein  27.92 
 
 
435 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0779  sulfotransferase  22.47 
 
 
258 aa  47  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3034  sulfotransferase family protein  20.35 
 
 
229 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1720  sulfotransferase  21.3 
 
 
289 aa  42.7  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192631  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>