24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4582 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_4582  sulfotransferase  100 
 
 
280 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0779  sulfotransferase  26.29 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0286  hypothetical protein  24.71 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511062  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1291  sulfotransferase  24.21 
 
 
290 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0517  sulfotransferase  25.75 
 
 
274 aa  60.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.485393  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0935  sulfotransferase  26.55 
 
 
279 aa  57  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016452 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0857  sulfotransferase  26.25 
 
 
289 aa  56.2  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129713  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1549  sulfotransferase  27.64 
 
 
258 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2689  sulfotransferase  22.34 
 
 
281 aa  53.9  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.184412 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0085  sulfotransferase  24.14 
 
 
287 aa  53.1  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.139736 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2217  Alcohol sulfotransferase  23.11 
 
 
287 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.116061 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2155  Alcohol sulfotransferase  23.11 
 
 
272 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0854  sulfotransferase  24.07 
 
 
299 aa  52.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0484  sulfotransferase  25.85 
 
 
314 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.948459  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0572  hypothetical protein  23.7 
 
 
348 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4140  sulfotransferase  23.83 
 
 
243 aa  50.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.888871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1354  sulfotransferase  27.97 
 
 
289 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1825  sulfotransferase  25.37 
 
 
302 aa  50.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.497043 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0057  sulfotransferase  25.28 
 
 
278 aa  49.3  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1278  sulfotransferase  26.69 
 
 
277 aa  47  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1720  sulfotransferase  24.36 
 
 
289 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192631  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3111  sulfotransferase  25.9 
 
 
329 aa  43.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1735  sulfotransferase  24.22 
 
 
289 aa  43.1  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.857227 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4186  sulfotransferase  24.12 
 
 
324 aa  42  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.593585  normal  0.326163 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>