36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1738 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4450  putative KfrA protein  100 
 
 		 345 aa  668    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.266051  normal  0.158271 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5043  putative KfrA protein  100 
 
 		 345 aa  668    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.206291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1738  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  668    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.432108 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4340  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  668    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.748561  normal  0.706664 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1626  hypothetical protein  62.02 
 
 		 385 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6381  hypothetical protein  60.31 
 
 		 411 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.779943  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6346  hypothetical protein  60.69 
 
 		 406 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00483484  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5788  hypothetical protein  73.94 
 
 		 220 aa  232  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1887  hypothetical protein  41.95 
 
 		 335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.949228 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7283  hypothetical protein  44.13 
 
 		 361 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0877183  normal  0.0144014 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1608  hypothetical protein  46.43 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146212  normal  0.149131 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7323  hypothetical protein  42.36 
 
 		 367 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0722826 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3965  hypothetical protein  48.28 
 
 		 339 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4402  hypothetical protein  48.28 
 
 		 339 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2033  hypothetical protein  38.76 
 
 		 354 aa  166  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100431 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4222  hypothetical protein  48.07 
 
 		 364 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.828479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5956  hypothetical protein  48.28 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.981401 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7008  hypothetical protein  33 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5697  hypothetical protein  27.57 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908607  hitchhiker  0.00495023 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5162  hypothetical protein  27.57 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0002  hypothetical protein  27.03 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4540  hypothetical protein  27.57 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.711481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3159  hypothetical protein  25.29 
 
 		 393 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4968  hypothetical protein  26.49 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3111  hypothetical protein  26.49 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.211252 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4155  hypothetical protein  27.72 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1506  hypothetical protein  25 
 
 		 395 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0597972  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0001  hypothetical protein  25 
 
 		 395 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0002  hypothetical protein  25 
 
 		 395 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0001  hypothetical protein  25 
 
 		 395 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0001  chromosome segregation ATPases  25 
 
 		 395 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.374592  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1427  hypothetical protein  25 
 
 		 395 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1147  hypothetical protein  25 
 
 		 395 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.014535  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0001  hypothetical protein  30 
 
 		 395 aa  54.3  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2946  FkbM family methyltransferase  25.65 
 
 		 786 aa  46.6  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50506  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6192  hypothetical protein  33.59 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0649171  hitchhiker  0.000226919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>