35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6346 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6346  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  762    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00483484  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6381  hypothetical protein  90.98 
 
 
411 aa  553  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.779943  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1626  hypothetical protein  81.69 
 
 
385 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4450  putative KfrA protein  54.93 
 
 
345 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.266051  normal  0.158271 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5043  putative KfrA protein  54.93 
 
 
345 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.206291  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1738  hypothetical protein  54.93 
 
 
345 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.432108 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4340  hypothetical protein  54.93 
 
 
345 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.748561  normal  0.706664 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1887  hypothetical protein  46.41 
 
 
335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.949228 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7283  hypothetical protein  48.07 
 
 
361 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0877183  normal  0.0144014 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5788  hypothetical protein  67.65 
 
 
220 aa  169  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7323  hypothetical protein  45.65 
 
 
367 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0722826 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1608  hypothetical protein  45.49 
 
 
340 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146212  normal  0.149131 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4222  hypothetical protein  45.02 
 
 
364 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.828479  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5956  hypothetical protein  45.04 
 
 
339 aa  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.981401 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3965  hypothetical protein  41.19 
 
 
339 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4402  hypothetical protein  41.19 
 
 
339 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2033  hypothetical protein  37.39 
 
 
354 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100431 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5697  hypothetical protein  29.84 
 
 
393 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908607  hitchhiker  0.00495023 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4540  hypothetical protein  29.84 
 
 
393 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.711481  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5162  hypothetical protein  29.84 
 
 
393 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0001  hypothetical protein  31.58 
 
 
395 aa  51.2  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0002  hypothetical protein  26.67 
 
 
393 aa  51.2  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7008  hypothetical protein  30 
 
 
401 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4968  hypothetical protein  27.34 
 
 
393 aa  50.1  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3111  hypothetical protein  26.62 
 
 
393 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.211252 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3159  hypothetical protein  31.62 
 
 
393 aa  47.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4155  hypothetical protein  25.26 
 
 
401 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0001  hypothetical protein  27.72 
 
 
395 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1427  hypothetical protein  27.72 
 
 
395 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1506  hypothetical protein  27.72 
 
 
395 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0597972  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1147  hypothetical protein  27.72 
 
 
395 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.014535  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0002  hypothetical protein  27.72 
 
 
395 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0001  hypothetical protein  27.72 
 
 
395 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0001  chromosome segregation ATPases  27.72 
 
 
395 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.374592  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4968  hypothetical protein  42.86 
 
 
282 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.503288  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>