34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1626 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1626  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  739    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6381  hypothetical protein  82.57 
 
 
411 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.779943  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6346  hypothetical protein  83.93 
 
 
406 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00483484  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4450  putative KfrA protein  56.04 
 
 
345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.266051  normal  0.158271 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5043  putative KfrA protein  56.04 
 
 
345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.206291  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1738  hypothetical protein  56.04 
 
 
345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.432108 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4340  hypothetical protein  56.04 
 
 
345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.748561  normal  0.706664 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1887  hypothetical protein  47.08 
 
 
335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.949228 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7283  hypothetical protein  42.63 
 
 
361 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0877183  normal  0.0144014 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5788  hypothetical protein  64.8 
 
 
220 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7323  hypothetical protein  43.02 
 
 
367 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0722826 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1608  hypothetical protein  45.32 
 
 
340 aa  163  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146212  normal  0.149131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2033  hypothetical protein  38.51 
 
 
354 aa  156  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100431 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4222  hypothetical protein  40.64 
 
 
364 aa  155  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.828479  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3965  hypothetical protein  43.12 
 
 
339 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4402  hypothetical protein  43.12 
 
 
339 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5956  hypothetical protein  43.75 
 
 
339 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.981401 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5162  hypothetical protein  29.41 
 
 
393 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5697  hypothetical protein  29.41 
 
 
393 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908607  hitchhiker  0.00495023 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4540  hypothetical protein  28.1 
 
 
393 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.711481  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0001  hypothetical protein  32.63 
 
 
395 aa  53.5  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0002  hypothetical protein  28.68 
 
 
393 aa  53.5  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3111  hypothetical protein  30.15 
 
 
393 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.211252 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4968  hypothetical protein  30.15 
 
 
393 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7008  hypothetical protein  27.2 
 
 
401 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0001  hypothetical protein  26.42 
 
 
395 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1427  hypothetical protein  26.42 
 
 
395 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1506  hypothetical protein  26.42 
 
 
395 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0597972  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1147  hypothetical protein  26.42 
 
 
395 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.014535  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0002  hypothetical protein  26.42 
 
 
395 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0001  hypothetical protein  26.42 
 
 
395 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0001  chromosome segregation ATPases  26.42 
 
 
395 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.374592  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3159  hypothetical protein  28.42 
 
 
393 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4155  hypothetical protein  25.49 
 
 
401 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>