18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4109 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4109  alanin-rich signal peptide protein  100 
 
 		 183 aa  332  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3996  putative alanine-rich signal peptide protein  100 
 
 		 183 aa  332  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186554  normal  0.500535 
 
 
-
 
NC_003296  RS04795  alanin-rich signal peptide protein  63.39 
 
 		 178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.372716  normal  0.0109755 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5664  hypothetical protein  58.57 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.736878 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1849  hypothetical protein  42.35 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3612  hypothetical protein  49.45 
 
 		 155 aa  99  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2366  hypothetical protein  47.25 
 
 		 158 aa  98.2  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1003  hypothetical protein  42.01 
 
 		 148 aa  96.7  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1939  hypothetical protein  44.71 
 
 		 157 aa  95.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.734564  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0478  hypothetical protein  40.59 
 
 		 141 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.913399  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0170  alanin-rich signal peptide protein  41.57 
 
 		 143 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1438  hypothetical protein  41.57 
 
 		 143 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4634  hypothetical protein  42.31 
 
 		 154 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3730  hypothetical protein  42.31 
 
 		 154 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.616789  normal  0.0368269 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3791  hypothetical protein  41.76 
 
 		 154 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.476277  normal  0.0556492 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0386  hypothetical protein  65.12 
 
 		 44 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2745  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  57.14 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000236948  normal  0.898271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1815  hypothetical protein  35.63 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>