18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A1939 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A1939  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  299  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.734564  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1849  hypothetical protein  96.18 
 
 
157 aa  233  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0170  alanin-rich signal peptide protein  80.25 
 
 
143 aa  213  8e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1438  hypothetical protein  80.25 
 
 
143 aa  213  8e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0478  hypothetical protein  80 
 
 
141 aa  207  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.913399  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1003  hypothetical protein  78.06 
 
 
148 aa  183  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3612  hypothetical protein  68.39 
 
 
155 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2366  hypothetical protein  67.72 
 
 
158 aa  156  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237169  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4634  hypothetical protein  64.52 
 
 
154 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3730  hypothetical protein  64.52 
 
 
154 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.616789  normal  0.0368269 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3791  hypothetical protein  63.87 
 
 
154 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.476277  normal  0.0556492 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5664  hypothetical protein  55.15 
 
 
165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.736878 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0386  hypothetical protein  95.45 
 
 
44 aa  90.9  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3996  putative alanine-rich signal peptide protein  44.6 
 
 
183 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186554  normal  0.500535 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4109  alanin-rich signal peptide protein  44.6 
 
 
183 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_003296  RS04795  alanin-rich signal peptide protein  67.39 
 
 
178 aa  70.9  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.372716  normal  0.0109755 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2745  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  53.66 
 
 
200 aa  53.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000236948  normal  0.898271 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1985  hypothetical protein  38.82 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>