19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS04795 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS04795  alanin-rich signal peptide protein  100 
 
 		 178 aa  329  1e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.372716  normal  0.0109755 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4109  alanin-rich signal peptide protein  63.93 
 
 		 183 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3996  putative alanine-rich signal peptide protein  63.93 
 
 		 183 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186554  normal  0.500535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5664  hypothetical protein  52.86 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.736878 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3612  hypothetical protein  46.15 
 
 		 155 aa  101  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2366  hypothetical protein  49.45 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1849  hypothetical protein  45.2 
 
 		 157 aa  98.2  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4634  hypothetical protein  43.96 
 
 		 154 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3730  hypothetical protein  43.96 
 
 		 154 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.616789  normal  0.0368269 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1003  hypothetical protein  39.66 
 
 		 148 aa  94.7  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3791  hypothetical protein  43.41 
 
 		 154 aa  94.4  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.476277  normal  0.0556492 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0170  alanin-rich signal peptide protein  41.67 
 
 		 143 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1438  hypothetical protein  41.67 
 
 		 143 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0478  hypothetical protein  41.24 
 
 		 141 aa  92  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.913399  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1939  hypothetical protein  42.94 
 
 		 157 aa  91.7  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.734564  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0386  hypothetical protein  69.77 
 
 		 44 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2745  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  53.49 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000236948  normal  0.898271 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1985  hypothetical protein  36.9 
 
 		 108 aa  43.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16890  LSU ribosomal protein L17P  33.7 
 
 		 242 aa  42  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>