18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3612 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3612  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  291  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2366  hypothetical protein  89.24 
 
 		 158 aa  206  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4634  hypothetical protein  80 
 
 		 154 aa  196  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3730  hypothetical protein  80 
 
 		 154 aa  196  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.616789  normal  0.0368269 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3791  hypothetical protein  79.35 
 
 		 154 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.476277  normal  0.0556492 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1849  hypothetical protein  68.39 
 
 		 157 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1939  hypothetical protein  68.39 
 
 		 157 aa  163  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.734564  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0478  hypothetical protein  63.23 
 
 		 141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.913399  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0170  alanin-rich signal peptide protein  63.23 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1438  hypothetical protein  63.23 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1003  hypothetical protein  61.29 
 
 		 148 aa  158  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5664  hypothetical protein  61.82 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.736878 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4109  alanin-rich signal peptide protein  51.8 
 
 		 183 aa  90.9  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3996  putative alanine-rich signal peptide protein  51.8 
 
 		 183 aa  90.9  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186554  normal  0.500535 
 
 
-
 
NC_003296  RS04795  alanin-rich signal peptide protein  78.26 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.372716  normal  0.0109755 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0386  hypothetical protein  83.72 
 
 		 44 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2745  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  51.16 
 
 		 200 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000236948  normal  0.898271 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1985  hypothetical protein  40.82 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>