23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5664 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5664  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  307  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.736878 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2366  hypothetical protein  59.39 
 
 		 158 aa  151  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3612  hypothetical protein  57.58 
 
 		 155 aa  150  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1849  hypothetical protein  55.15 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4634  hypothetical protein  58.18 
 
 		 154 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3730  hypothetical protein  58.18 
 
 		 154 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.616789  normal  0.0368269 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3791  hypothetical protein  57.58 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.476277  normal  0.0556492 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1438  hypothetical protein  52.73 
 
 		 143 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0170  alanin-rich signal peptide protein  52.73 
 
 		 143 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0478  hypothetical protein  52.73 
 
 		 141 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.913399  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1939  hypothetical protein  52.73 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.734564  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1003  hypothetical protein  50.3 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4109  alanin-rich signal peptide protein  55 
 
 		 183 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3996  putative alanine-rich signal peptide protein  55 
 
 		 183 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186554  normal  0.500535 
 
 
-
 
NC_003296  RS04795  alanin-rich signal peptide protein  82.61 
 
 		 178 aa  87.8  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.372716  normal  0.0109755 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0386  hypothetical protein  69.77 
 
 		 44 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2745  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  51.06 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000236948  normal  0.898271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0444  hypothetical protein  42.55 
 
 		 99 aa  41.6  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3513  hypothetical protein  37.29 
 
 		 99 aa  41.6  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0207197  normal  0.0855727 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2880  hypothetical protein  38.3 
 
 		 102 aa  40.8  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0918208 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3594  hypothetical protein  42.55 
 
 		 150 aa  40.8  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1933  hypothetical protein  42.55 
 
 		 142 aa  40.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781064  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0511  hypothetical protein  42.55 
 
 		 142 aa  40.4  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.133387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>