71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4009 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_3895  protein of unknown function DUF1697  100 
 
 		 169 aa  342  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.547846  normal  0.243704 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4009  protein of unknown function DUF1697  100 
 
 		 169 aa  342  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0709322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3316  hypothetical protein  67.46 
 
 		 170 aa  237  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.547905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1076  hypothetical protein  64.88 
 
 		 171 aa  207  7e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2140  protein of unknown function DUF1697  63.8 
 
 		 181 aa  200  8e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2349  hypothetical protein  58.33 
 
 		 169 aa  193  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0125  protein of unknown function DUF1697  53.49 
 
 		 173 aa  167  7e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0986  protein of unknown function DUF1697  50.9 
 
 		 174 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0859  protein of unknown function DUF1697  50.9 
 
 		 172 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.508227 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0598  hypothetical protein  49.11 
 
 		 176 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0049  hypothetical protein  41.76 
 
 		 174 aa  127  8.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5447  hypothetical protein  37.43 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0516  hypothetical protein  35.8 
 
 		 184 aa  107  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.260379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4791  protein of unknown function DUF1697  37.71 
 
 		 179 aa  99.4  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4833  protein of unknown function DUF1697  35.39 
 
 		 181 aa  93.6  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0683278  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3366  hypothetical protein  38.07 
 
 		 179 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0461169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1495  protein of unknown function DUF1697  35.03 
 
 		 181 aa  89.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0351955 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4577  protein of unknown function DUF1697  35.8 
 
 		 175 aa  89.4  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1422  hypothetical protein  37.57 
 
 		 181 aa  86.7  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04955  hypothetical protein  26.32 
 
 		 177 aa  84.7  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3525  hypothetical protein  34.97 
 
 		 180 aa  84  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2796  hypothetical protein  30.46 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.255726  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2570  protein of unknown function DUF1697  29.94 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2775  hypothetical protein  29.89 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000631538  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0591  hypothetical protein  30.05 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2477  hypothetical protein  29.89 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00147015  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2754  hypothetical protein  28.32 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2750  hypothetical protein  29.89 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000420555 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2742  hypothetical protein  29.89 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.339272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2556  hypothetical protein  29.89 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216201  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2548  hypothetical protein  31.84 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2585  protein of unknown function DUF1697  33.52 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.643987  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2489  hypothetical protein  33.89 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0786308  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2470  protein of unknown function DUF1697  31.28 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.110184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1050  hypothetical protein  40.54 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2538  hypothetical protein  27.17 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000984258 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1395  hypothetical protein  32.14 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.751897 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2417  protein of unknown function DUF1697  37.41 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.012965 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0097  hypothetical protein  38.64 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.284387  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2992  protein of unknown function DUF1697  30.51 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.340866 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2933  hypothetical protein  25.7 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.488628  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3173  hypothetical protein  31.43 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0323444  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4323  hypothetical protein  34.27 
 
 		 195 aa  72  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26880  hypothetical protein  37.22 
 
 		 190 aa  72  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.196788  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2521  hypothetical protein  32.76 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.350992  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2772  protein of unknown function DUF1697  32.76 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.223972  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2030  protein of unknown function DUF1697  28.9 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0740176  hitchhiker  0.00584791 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5780  hypothetical protein  41.38 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2046  protein of unknown function DUF1697  27.17 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4288  hypothetical protein  44.57 
 
 		 179 aa  67.4  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3789  hypothetical protein  32.2 
 
 		 180 aa  67.4  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1006  protein of unknown function DUF1697  31.67 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1387  hypothetical protein  36.59 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0176326  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1298  hypothetical protein  29.38 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1053  hypothetical protein  26.44 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1268  protein of unknown function DUF1697  33.33 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00196916  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1764  hypothetical protein  32.23 
 
 		 180 aa  62  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2927  hypothetical protein  33.55 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.108096  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2096  protein of unknown function DUF1697  39.13 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0639212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1846  protein of unknown function DUF1697  25.73 
 
 		 175 aa  60.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0111817  normal  0.050491 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1652  protein of unknown function DUF1697  32.4 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0262317  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4583  hypothetical protein  32.17 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855565  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2327  hypothetical protein  37.5 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4059  hypothetical protein  45.33 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2258  protein of unknown function DUF1697  31.07 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166677 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4134  hypothetical protein  45.33 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.901726 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1574  protein of unknown function DUF1697  31.28 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1661  hypothetical protein  26.63 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.445332  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4434  hypothetical protein  34.07 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.823074  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2296  hypothetical protein  30.73 
 
 		 179 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11178  hypothetical protein  34.78 
 
 		 213 aa  52  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>