70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3525 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3525  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  368  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2772  protein of unknown function DUF1697  50 
 
 
176 aa  187  9e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.223972  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4791  protein of unknown function DUF1697  46.02 
 
 
179 aa  146  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0591  hypothetical protein  43.33 
 
 
179 aa  142  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1661  hypothetical protein  43.02 
 
 
172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.445332  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1395  hypothetical protein  44.19 
 
 
171 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.751897 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1422  hypothetical protein  41.57 
 
 
181 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2750  hypothetical protein  41.01 
 
 
178 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000420555 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2754  hypothetical protein  39.89 
 
 
178 aa  115  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2742  hypothetical protein  40.45 
 
 
178 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.339272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2477  hypothetical protein  40.68 
 
 
178 aa  114  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00147015  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2556  hypothetical protein  40.45 
 
 
178 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216201  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0516  hypothetical protein  37.57 
 
 
184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.260379  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2796  hypothetical protein  41.01 
 
 
178 aa  111  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.255726  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2775  hypothetical protein  40.98 
 
 
178 aa  108  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000631538  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2538  hypothetical protein  38.76 
 
 
178 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000984258 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04955  hypothetical protein  35.96 
 
 
177 aa  107  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2470  protein of unknown function DUF1697  36.26 
 
 
178 aa  105  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.110184  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0859  protein of unknown function DUF1697  38.55 
 
 
172 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.508227 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2548  hypothetical protein  38.76 
 
 
178 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2585  protein of unknown function DUF1697  33.53 
 
 
179 aa  101  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.643987  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5447  hypothetical protein  35.63 
 
 
174 aa  99.4  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4833  protein of unknown function DUF1697  35.63 
 
 
181 aa  99.8  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0683278  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0986  protein of unknown function DUF1697  37.85 
 
 
174 aa  98.6  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1495  protein of unknown function DUF1697  34.48 
 
 
181 aa  97.1  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0351955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3173  hypothetical protein  36.31 
 
 
180 aa  96.3  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0323444  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2927  hypothetical protein  35 
 
 
180 aa  93.6  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.108096  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2570  protein of unknown function DUF1697  34.59 
 
 
184 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2030  protein of unknown function DUF1697  34.08 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0740176  hitchhiker  0.00584791 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0125  protein of unknown function DUF1697  34.44 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0049  hypothetical protein  35 
 
 
174 aa  87.8  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2417  protein of unknown function DUF1697  32.22 
 
 
177 aa  87.4  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.012965 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2992  protein of unknown function DUF1697  30.51 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.340866 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1076  hypothetical protein  34.09 
 
 
171 aa  85.9  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0598  hypothetical protein  34.64 
 
 
176 aa  84  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2933  hypothetical protein  30.56 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.488628  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3366  hypothetical protein  33.15 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0461169  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2140  protein of unknown function DUF1697  34.09 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3316  hypothetical protein  33.7 
 
 
170 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.547905  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3895  protein of unknown function DUF1697  34.97 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.547846  normal  0.243704 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4009  protein of unknown function DUF1697  34.97 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0709322  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4577  protein of unknown function DUF1697  32.57 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2349  hypothetical protein  33.9 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2489  hypothetical protein  30.56 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0786308  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1764  hypothetical protein  30.17 
 
 
180 aa  70.9  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26880  hypothetical protein  28.57 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.196788  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2327  hypothetical protein  30.6 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4323  hypothetical protein  27.47 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1268  protein of unknown function DUF1697  38.64 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00196916  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2096  protein of unknown function DUF1697  29.83 
 
 
176 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0639212  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1387  hypothetical protein  29.08 
 
 
186 aa  62.8  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0176326  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4288  hypothetical protein  28.09 
 
 
179 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19737  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4059  hypothetical protein  29.78 
 
 
179 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4134  hypothetical protein  29.78 
 
 
179 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.901726 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5780  hypothetical protein  28.18 
 
 
183 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.776481 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11178  hypothetical protein  27.07 
 
 
213 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3789  hypothetical protein  26.74 
 
 
180 aa  61.6  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2296  hypothetical protein  25.93 
 
 
179 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0097  hypothetical protein  42.22 
 
 
174 aa  60.1  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.284387  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1006  protein of unknown function DUF1697  39.77 
 
 
174 aa  60.1  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1053  hypothetical protein  25.95 
 
 
179 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1050  hypothetical protein  30.68 
 
 
183 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1652  protein of unknown function DUF1697  24.87 
 
 
179 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0262317  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1574  protein of unknown function DUF1697  26.78 
 
 
179 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2258  protein of unknown function DUF1697  31.63 
 
 
186 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166677 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3116  putative cytoplasmic protein  29.91 
 
 
134 aa  45.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.531876  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2521  hypothetical protein  26.92 
 
 
183 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.350992  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12770  hypothetical protein  25.51 
 
 
196 aa  46.2  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.296317  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2046  protein of unknown function DUF1697  25 
 
 
175 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0153  hypothetical protein  26.92 
 
 
179 aa  42  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>