56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4583 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4583  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  347  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855565  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4434  hypothetical protein  78.62 
 
 
159 aa  263  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.823074  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3366  hypothetical protein  28.49 
 
 
179 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0461169  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2992  protein of unknown function DUF1697  34.82 
 
 
179 aa  62  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.340866 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0097  hypothetical protein  27.06 
 
 
174 aa  60.8  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.284387  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4288  hypothetical protein  42.11 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19737  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4059  hypothetical protein  42.11 
 
 
179 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4134  hypothetical protein  42.11 
 
 
179 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.901726 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1076  hypothetical protein  29.14 
 
 
171 aa  60.5  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0516  hypothetical protein  26.16 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.260379  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4323  hypothetical protein  31.03 
 
 
195 aa  56.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1387  hypothetical protein  34.83 
 
 
186 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0176326  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2349  hypothetical protein  31.69 
 
 
169 aa  56.6  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3789  hypothetical protein  33.04 
 
 
180 aa  55.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2258  protein of unknown function DUF1697  35.16 
 
 
186 aa  55.5  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2585  protein of unknown function DUF1697  27.68 
 
 
179 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.643987  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0153  hypothetical protein  30.73 
 
 
179 aa  54.7  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3173  hypothetical protein  27.12 
 
 
180 aa  54.3  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0323444  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3895  protein of unknown function DUF1697  31.48 
 
 
169 aa  53.9  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.547846  normal  0.243704 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4009  protein of unknown function DUF1697  31.48 
 
 
169 aa  53.9  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0709322  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2927  hypothetical protein  26.97 
 
 
180 aa  53.9  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.108096  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1495  protein of unknown function DUF1697  27.59 
 
 
181 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0351955 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3316  hypothetical protein  27.68 
 
 
170 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.547905  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1268  protein of unknown function DUF1697  30.69 
 
 
180 aa  52.4  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00196916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2754  hypothetical protein  29.41 
 
 
178 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0986  protein of unknown function DUF1697  32.18 
 
 
174 aa  52  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2030  protein of unknown function DUF1697  28.41 
 
 
182 aa  51.2  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0740176  hitchhiker  0.00584791 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2750  hypothetical protein  27.91 
 
 
178 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000420555 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2477  hypothetical protein  28.21 
 
 
178 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00147015  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2742  hypothetical protein  27.91 
 
 
178 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.339272  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2046  protein of unknown function DUF1697  25.58 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2556  hypothetical protein  27.91 
 
 
178 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216201  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0859  protein of unknown function DUF1697  31.79 
 
 
172 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.508227 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1764  hypothetical protein  46.94 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2548  hypothetical protein  30.25 
 
 
178 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2570  protein of unknown function DUF1697  28 
 
 
184 aa  48.5  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1846  protein of unknown function DUF1697  24.29 
 
 
175 aa  48.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0111817  normal  0.050491 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2538  hypothetical protein  27.83 
 
 
178 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000984258 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1053  hypothetical protein  28.21 
 
 
179 aa  48.1  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4791  protein of unknown function DUF1697  22.91 
 
 
179 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2470  protein of unknown function DUF1697  27.43 
 
 
178 aa  47.4  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.110184  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2796  hypothetical protein  29.63 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.255726  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2775  hypothetical protein  29.63 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000631538  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5447  hypothetical protein  29.46 
 
 
174 aa  45.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04955  hypothetical protein  25 
 
 
177 aa  45.8  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1050  hypothetical protein  26.88 
 
 
183 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4833  protein of unknown function DUF1697  29.31 
 
 
181 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0683278  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1422  hypothetical protein  26.63 
 
 
181 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2772  protein of unknown function DUF1697  25.73 
 
 
176 aa  43.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.223972  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0125  protein of unknown function DUF1697  26.29 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2521  hypothetical protein  32.97 
 
 
183 aa  43.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.350992  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11178  hypothetical protein  25.97 
 
 
213 aa  43.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2417  protein of unknown function DUF1697  28.1 
 
 
177 aa  42  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.012965 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5780  hypothetical protein  41.67 
 
 
183 aa  41.6  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.776481 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1652  protein of unknown function DUF1697  24.02 
 
 
179 aa  40.8  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0262317  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1574  protein of unknown function DUF1697  24.02 
 
 
179 aa  40.8  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>