56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1298 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1298  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  355  1.9999999999999998e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2585  protein of unknown function DUF1697  32.58 
 
 		 179 aa  84.3  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.643987  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3789  hypothetical protein  30.29 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04955  hypothetical protein  23.53 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3316  hypothetical protein  39.76 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.547905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2570  protein of unknown function DUF1697  27.62 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1652  protein of unknown function DUF1697  30.46 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0262317  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4009  protein of unknown function DUF1697  45.45 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0709322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3895  protein of unknown function DUF1697  45.45 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.547846  normal  0.243704 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1395  hypothetical protein  28 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.751897 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1574  protein of unknown function DUF1697  29.31 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2296  hypothetical protein  29.31 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4323  hypothetical protein  32 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2992  protein of unknown function DUF1697  29.34 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.340866 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0125  protein of unknown function DUF1697  32.02 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0591  hypothetical protein  28.89 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2030  protein of unknown function DUF1697  29.38 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0740176  hitchhiker  0.00584791 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4577  protein of unknown function DUF1697  29.07 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4791  protein of unknown function DUF1697  29.12 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2046  protein of unknown function DUF1697  25.58 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0859  protein of unknown function DUF1697  29.78 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.508227 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0598  hypothetical protein  28.41 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1268  protein of unknown function DUF1697  30 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00196916  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2470  protein of unknown function DUF1697  26.29 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.110184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2772  protein of unknown function DUF1697  30.18 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.223972  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0097  hypothetical protein  32.94 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.284387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2556  hypothetical protein  23.3 
 
 		 178 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216201  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2750  hypothetical protein  23.67 
 
 		 178 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000420555 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2477  hypothetical protein  23.3 
 
 		 178 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00147015  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2742  hypothetical protein  23.3 
 
 		 178 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.339272  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0986  protein of unknown function DUF1697  26.14 
 
 		 174 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2796  hypothetical protein  23.86 
 
 		 178 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.255726  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1387  hypothetical protein  28.89 
 
 		 186 aa  51.2  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0176326  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1076  hypothetical protein  27.34 
 
 		 171 aa  51.2  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2548  hypothetical protein  24.43 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3173  hypothetical protein  25.14 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0323444  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3366  hypothetical protein  34.88 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0461169  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2775  hypothetical protein  22.73 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000631538  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1764  hypothetical protein  28.89 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1846  protein of unknown function DUF1697  23.39 
 
 		 175 aa  48.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0111817  normal  0.050491 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2754  hypothetical protein  22.49 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2927  hypothetical protein  25.14 
 
 		 180 aa  48.1  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.108096  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1050  hypothetical protein  34.17 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5780  hypothetical protein  38.98 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776481 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2349  hypothetical protein  29.73 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0049  hypothetical protein  23.53 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1006  protein of unknown function DUF1697  22.22 
 
 		 174 aa  46.2  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2140  protein of unknown function DUF1697  35.06 
 
 		 181 aa  45.1  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1053  hypothetical protein  26.11 
 
 		 179 aa  45.1  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5447  hypothetical protein  26.99 
 
 		 174 aa  44.7  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1495  protein of unknown function DUF1697  22.73 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0351955 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4434  hypothetical protein  35.11 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.823074  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4833  protein of unknown function DUF1697  27.27 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0683278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2538  hypothetical protein  21.02 
 
 		 178 aa  42  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000984258 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26880  hypothetical protein  25.93 
 
 		 190 aa  41.6  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.196788  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3525  hypothetical protein  23.95 
 
 		 180 aa  41.6  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>