28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1547 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1547  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  274  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683626  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4863  hypothetical protein  57.48 
 
 		 132 aa  159  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.368974  normal  0.880715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1127  hypothetical protein  46.4 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.332513 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1617  hypothetical protein  47.58 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1592  hypothetical protein  44.35 
 
 		 172 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0782726  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3892  hypothetical protein  41.94 
 
 		 205 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0392964  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1843  hypothetical protein  38.46 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4182  hypothetical protein  29.06 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02499  hypothetical protein  28.93 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0456  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.43 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4231  cupin 2, barrel  32.17 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03688  hypothetical protein  29.13 
 
 		 172 aa  50.4  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1980  hypothetical protein  25.21 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00382946 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5207  hypothetical protein  28.44 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1385  protein of unknown function DUF861 cupin_3  23.66 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000336735  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3522  hypothetical protein  24.37 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.07 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7070  hypothetical protein  33.93 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5416  cupin 2 domain-containing protein  29.03 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1350  cupin 2 domain-containing protein  41.3 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.687777  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3129  hypothetical protein  32.88 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0098  hypothetical protein  30.14 
 
 		 267 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1060  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  41.2  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.597208  normal  0.0759918 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46817  predicted protein  40.82 
 
 		 194 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.410977  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1305  hypothetical protein  29.17 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1344  hypothetical protein  35.48 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0765  hypothetical protein  29.33 
 
 		 189 aa  40  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.618728  normal  0.762349 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3421  cupin 2 domain-containing protein  34.43 
 
 		 171 aa  40  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.357216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>