14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3892 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3892  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  428  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0392964  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1592  hypothetical protein  83.14 
 
 		 172 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0782726  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1127  hypothetical protein  51.69 
 
 		 120 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.332513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4863  hypothetical protein  45.04 
 
 		 132 aa  116  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.368974  normal  0.880715 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1547  hypothetical protein  41.94 
 
 		 133 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683626  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1617  hypothetical protein  41.13 
 
 		 126 aa  98.6  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1843  hypothetical protein  39.55 
 
 		 160 aa  85.1  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4182  hypothetical protein  36.71 
 
 		 116 aa  60.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0456  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.93 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02499  hypothetical protein  43.64 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4231  cupin 2, barrel  40 
 
 		 121 aa  49.3  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5207  hypothetical protein  38.46 
 
 		 138 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0765  hypothetical protein  32.22 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.618728  normal  0.762349 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0098  hypothetical protein  35.29 
 
 		 267 aa  42.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>