17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02499 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02499  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  250  5.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0456  protein of unknown function DUF861 cupin_3  68.6 
 
 		 121 aa  184  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4182  hypothetical protein  40.87 
 
 		 116 aa  102  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1617  hypothetical protein  37.93 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1385  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.78 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000336735  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4231  cupin 2, barrel  35.92 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4863  hypothetical protein  33.61 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.368974  normal  0.880715 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5207  hypothetical protein  37.62 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1127  hypothetical protein  30.58 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.332513 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0098  hypothetical protein  35.92 
 
 		 267 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1592  hypothetical protein  46.43 
 
 		 172 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0782726  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1547  hypothetical protein  28.93 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683626  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3892  hypothetical protein  32.89 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0392964  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1843  hypothetical protein  37.88 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7070  hypothetical protein  29.09 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1980  hypothetical protein  31.53 
 
 		 127 aa  52.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00382946 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3522  hypothetical protein  27.27 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0966069 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>