20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4863 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4863  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  272  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.368974  normal  0.880715 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1547  hypothetical protein  57.48 
 
 
133 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683626  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1617  hypothetical protein  52.34 
 
 
126 aa  132  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1127  hypothetical protein  48.06 
 
 
120 aa  123  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.332513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1592  hypothetical protein  45.8 
 
 
172 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0782726  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3892  hypothetical protein  45.04 
 
 
205 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0392964  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1843  hypothetical protein  52.54 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4182  hypothetical protein  33.61 
 
 
116 aa  72  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02499  hypothetical protein  33.61 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0456  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.02 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4231  cupin 2, barrel  31.3 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1385  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.33 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000336735  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5207  hypothetical protein  28.3 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0765  hypothetical protein  32.97 
 
 
189 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.618728  normal  0.762349 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03688  hypothetical protein  34.04 
 
 
172 aa  45.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1344  hypothetical protein  30.85 
 
 
190 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0098  hypothetical protein  32.26 
 
 
267 aa  43.5  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2381  hypothetical protein  38.98 
 
 
180 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7070  hypothetical protein  26.09 
 
 
120 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1980  hypothetical protein  26.05 
 
 
127 aa  40  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00382946 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>